基因流（也稱基因遷移）是指從一個(gè)物種的一個(gè)種群向另一個(gè)種群引入新的遺傳物質(zhì)，從而改變?nèi)后w“基因庫(kù)”的組成。通過(guò)基因交流向群體中引入新的等位基因，...
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群體進(jìn)化分析--基因流及群體歷史分析——我愿稱之為史上最全 -
使用ITSx進(jìn)行ITS2序列的提取
目的 生工測(cè)序回來(lái)的文件名稱比較復(fù)雜，且不能直接進(jìn)行ITS2序列鑒定，之前都是一個(gè)文件一個(gè)文件的添加">"再用ITSx一個(gè)個(gè)的跑，耗費(fèi)時(shí)間比較長(zhǎng)...
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ABBA-BABA 檢驗(yàn)
ABBA-BABA檢驗(yàn)是一種用于識(shí)別基因流的方法，它基于四群體模型，其中包括兩個(gè)與第三個(gè)群體（P3）密切相關(guān)的群體（P1和P2），以及一個(gè)外群（...
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DFOIL 檢驗(yàn)
DFOIL 檢驗(yàn)是一種用于確定基因流方向的統(tǒng)計(jì)方法，它基于五群體系統(tǒng)發(fā)育樹的分析。DFOIL檢驗(yàn)是 ABBA-BABA 檢驗(yàn)的擴(kuò)展，它通過(guò)考慮更...
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群體雜交漸滲基因流軟件基因型填充 - fillGenotype - beagle 基因型填充(Genotype-Imputation)：從原理到操作 - 知乎 (zh...
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PSMC軟件分析群體歷史有效群體大小步驟（bcftools+PSMC)）
PSMC軟件分析群體歷史有效群體大小流程 1 文件轉(zhuǎn)換 基因組文件格式為.bam，callsnp之后，再轉(zhuǎn)換為.fq.gz格式才能做為PSMC輸...
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生信分析16：基于PSMC估計(jì)有效群體大小本次推送是文獻(xiàn)分享16的對(duì)應(yīng)內(nèi)容。 Fig 1 有效群體大小的估計(jì)或者種群歷史動(dòng)態(tài)的估計(jì)經(jīng)常出現(xiàn)在基因組/重測(cè)序相關(guān)文章中，可視化形式一般是Fi...
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