寫在開頭
終于開始系統(tǒng)的學(xué)習(xí)生信了,在今天之前的接近1個(gè)月的時(shí)間里,幾乎每天熬夜學(xué)習(xí)數(shù)據(jù)挖掘,但是僅僅停留在表面,目的很簡單,就想學(xué)會(huì)套路,寫文章,想必很多小伙伴都是跟我一樣的想法。
在查找資料的時(shí)候發(fā)現(xiàn)了生信星球,繼而發(fā)現(xiàn)了豆花組合,很羨慕他們,也祝福他們。
希望我們97期培訓(xùn)班的小伙伴都能學(xué)到自己想要的東西。
第一天的學(xué)習(xí)筆記
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搜索
通用搜索引擎:
我們的教程中提到的軟件、網(wǎng)頁等等,全部可以搜到。學(xué)會(huì)搜索是學(xué)習(xí)任何新知識(shí)的第一步,包括以后要下載軟件、解決報(bào)錯(cuò)、某個(gè)不夠詳細(xì)的點(diǎn)想要展開自學(xué)等,都需要搜索,這是必須的。
首選-谷歌,其次-必應(yīng),另外推薦一個(gè)大神級的搜索引擎:蟲部落快搜。里面幾乎集成了所有的搜索引擎啦!
專業(yè)教程,推薦使用:
搜狗微信、搜狗知乎、簡書、github
你并不需要鏈接!!因?yàn)橹苯尤ニ丫W(wǎng)站名字,就能搜到,大多數(shù)的人會(huì)想不到可以搜索,學(xué)生信,或者說學(xué)編程語言,必須有搜索的思維和意識(shí)哦。
哈哈,很無恥的把內(nèi)容都復(fù)制過來了,因?yàn)檫@也是之前我在學(xué)習(xí)新東西的感悟,一定要學(xué)會(huì)應(yīng)用各種搜索引擎,文章里推薦了搜狗、微信、知乎、簡書、github,其實(shí)還有一些別的,比如CSDN,360doc個(gè)人圖書館,生信菜鳥團(tuán)等網(wǎng)站,都會(huì)有很好的知識(shí)分享,當(dāng)然在搜索的過程中,也會(huì)發(fā)現(xiàn)一些大牛自己建立的個(gè)人博客。
很贊同下面這句話
學(xué)生信,或者說學(xué)編程語言,必須有搜索的思維和意識(shí)。
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提問
- 一定要帶上下文和截圖
- 學(xué)會(huì)利用微信群,不止我們這一期的培訓(xùn)班的群,在一些網(wǎng)站上看到的關(guān)于技術(shù)有關(guān)的群都可以申請加入。
- 論壇——是我想增加的一點(diǎn),在我前期的學(xué)習(xí)過程中,給大家推薦一些論壇,比如丁香園、經(jīng)管之家、生信技能樹、小木蟲、知乎等。這些地方也是我們?yōu)榻鉀Q各種疑難雜癥去求醫(yī)問藥的寶地。
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高效的學(xué)習(xí)平臺(tái)
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chrome
自己以前一直在使用360激情瀏覽器,因?yàn)楦杏X它很激情,哈哈哈哈,主要是從上大學(xué)一直在用,使用順手了,并且一些很有用的收藏都在上面,其實(shí)內(nèi)核都是chrome,此類的瀏覽器還有火狐瀏覽器,不知道大家發(fā)現(xiàn)沒,這個(gè)火狐瀏覽器似乎是很多考試報(bào)名欽點(diǎn)的瀏覽器。 -
everything
連接一下下載地址
同樣推薦,比較好用。 -
截圖工具
個(gè)人喜歡用微信的截圖,蘿卜青菜各有所愛~ -
幕布和Xmind
自己用的是幕布,是從Jimmy大神的視頻教程里看到了這個(gè)軟件,看他做的思維導(dǎo)圖很好看,就下載了一個(gè),基本功能是免費(fèi)的,不過也足夠使用了,沒有用過Xmind這個(gè)軟件,不做評論,不過此類軟件都是大同小異,網(wǎng)上還有很多類似的軟件,以及一些在線網(wǎng)站也有同樣的功能,比如百度腦圖,我也沒有用過,但是聽說過,哈哈。 - 筆記軟件
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簡書
推薦,方便交流和查找,但是基于網(wǎng)絡(luò)的不確定因素太多,太私人的內(nèi)容還是別在上面叭叭叭了。雖然上面有日記本的功能,還不如買個(gè)帶密碼鎖的筆記本,寫寫日記,練練字。 -
印象筆記、有道云筆記
此類軟件很多,也是網(wǎng)絡(luò)的,看個(gè)人愛好。 -
OneNote
微軟出品,也可以是精品,現(xiàn)在我就在用onenote來做筆記,強(qiáng)烈推薦一下。這款軟件可以同步,可以安裝各種插件(有需要的自行搜索),并且使用的時(shí)候和word界面類似,比較順手,有興趣的小伙伴可以試一下! -
GitNote
這也是在尋找順手筆記軟件的時(shí)候發(fā)現(xiàn)的一款軟件,是國內(nèi)的一個(gè)大?;贕ithub編寫的一款軟件,有興趣的小伙伴可以嘗試一下。我和作者聊過,最近在改版升級,升級后的版本可能會(huì)更好用,拭目以待吧~,玷污我下載GitNote -
360doc
在這里還要推薦一下360doc個(gè)人圖書館這個(gè)網(wǎng)站和軟件,這個(gè)網(wǎng)站有個(gè)神器360網(wǎng)文摘手,可以一鍵把網(wǎng)頁里面主體內(nèi)容選擇并調(diào)整到專用的修改器界面里,圖片也包括在內(nèi),很方便。推薦大家嘗試一下~ -
Markdown
最后再聊聊Markdown,寫這篇文章的時(shí)候是根據(jù)教程1和教程2以及寫作界面里面的Markdown語法參考完成的。

整篇寫下來還算比較順手,哈哈。
用熟練了應(yīng)該會(huì)更舒服一些,現(xiàn)在很多網(wǎng)站和App都開啟了Markdown支持,方便發(fā)文,R語言中也有Markdown,不是很熟悉,不知道是不是一樣的功能,還有待進(jìn)一步開發(fā)。
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貼一段代碼,完成作業(yè),是自己之前一行一行注釋過的代碼~
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大神勿噴
#把pdata臨床信息中的 title列按照_分割
#[,2:3]取title列中第2-3列
group_list=str_split(pd$title,'_',simplify = T)[,2:3]
#class(group_list)
x=group_list[1,]#把group_list第一行數(shù)值賦值為x,
#《R語言實(shí)戰(zhàn)》P95,apply函數(shù)用法
group_list=apply(group_list,1,function(x) paste(x,collapse='_'))#對每一行進(jìn)行操作
#函數(shù)apply用法:apply(X, MARGIN, FUN, ...)
#X: an array, including a matrix.
#MARGIN: 1:行操作; 2:列操作
#FUN:函數(shù)名
#得到下面結(jié)果
#[1] "at 3h after trauma_rep1" "at 3h after trauma_rep2"
#[3] "at 3h after trauma_rep3" "at 6h after trauma_rep1"
#[5] "at 6h after trauma_rep2" "at 6h aftert rauma_rep3"
#[7] "at 12h after trauma_rep1" "at 12h after trauma_rep2"
#[9] "at 12h after trauma_rep3" "at 48h after trauma_rep1"
#[11] "at 48h after trauma_rep2" "at 48h after trauma_rep3"
#[13] "sham_3h" "sham_6h"
#[15] "sham_12h" "sham_48h"
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寫在最后
- 在過去的2020年,實(shí)現(xiàn)了自己的幾個(gè)目標(biāo),還比較滿意,當(dāng)然,有得必有失,此處略去一些字。
- 學(xué)習(xí)生信是給自己定的下一個(gè)目標(biāo),希望自己能順利完成。
- 網(wǎng)上很多值得學(xué)習(xí)的內(nèi)容,但有一些有頭沒尾,有一些有尾沒頭,學(xué)習(xí)起來的確是很費(fèi)勁,回想這一段時(shí)間的學(xué)習(xí),走了很多彎路,但同時(shí)也學(xué)到了很多。
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希望大家學(xué)有所成,心想事成!