分析
單細胞分析實錄(2): 使用Cell Ranger得到表達矩陣
單細胞分析實錄(3): Cell Hashing數(shù)據(jù)拆分
單細胞分析實錄(6): 去除批次效應(yīng)/整合數(shù)據(jù)
單細胞分析實錄(8): 展示marker基因的4種圖形（一）
單細胞分析實錄(9): 展示marker基因的4種圖形（二）
單細胞分析實錄(13): inferCNV結(jié)合UPhyloplot2分析腫瘤進化
單細胞分析實錄(14): 細胞類型注釋的另一種思路 — CellID
單細胞分析實錄(16): 非負矩陣分解(NMF)檢測細胞異質(zhì)性
單細胞分析實錄(18): 基于CellPhoneDB的細胞通訊分析及可視化 (上篇)
單細胞分析實錄(19): 基于CellPhoneDB的細胞通訊分析及可視化 (下篇)
【代碼更新】單細胞分析實錄(20): 將多個樣本的CNV定位到染色體臂，并畫熱圖
【代碼更新】單細胞分析實錄(21): 非負矩陣分解(NMF)的R代碼實現(xiàn)，只需兩步，啥圖都有
高級繪圖
B站視頻教程
單細胞轉(zhuǎn)錄組繪圖視頻教程（B站收藏量破千，觀看量近萬）
跟著Cell Research學(xué)單細胞分析：箱型圖、小提琴圖、誤差棒，總有一款適合你
跟著Cell Research學(xué)單細胞分析：以小提琴圖、熱圖為例
【代碼更新】單細胞分析實錄(21): 非負矩陣分解(NMF)的R代碼實現(xiàn)，只需兩步，啥圖都有
文獻解讀
文獻(1): Cell_早期復(fù)發(fā)肝細胞癌的單細胞圖譜
文獻(2): 綜述_癌癥相關(guān)成纖維細胞(CAF)的異質(zhì)性【建議收藏】
文獻(3): IF=13|單細胞測序揭示泛-神經(jīng)母細胞瘤特征
文獻(4): Nature子刊_晚期非小細胞肺癌的單細胞圖譜
文獻(5): 單細胞轉(zhuǎn)錄組揭示人類纖維化皮膚病中成纖維細胞的異質(zhì)性
文獻(6): 原發(fā)性肝癌空間結(jié)構(gòu)綜合分析
文獻(7): 在非小細胞肺癌中，漿細胞signature可用于PD-L1免疫治療的響應(yīng)預(yù)測
雜說
答讀者問(1)：非模式物種找marker；如何根據(jù)marker定義細胞類型
答讀者問(2)：細胞cluster沒有聚在一起；去不去批次效應(yīng)
Cerebro：一個好用的單細胞數(shù)據(jù)展示shiny工具
他山之石
免疫學(xué)基礎(chǔ)——人類免疫細胞及其marker
Tutorial | 單細胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)【細胞注釋指南】
GRNdb：單細胞水平的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫
2022NAR數(shù)據(jù)庫特刊：單細胞數(shù)據(jù)庫合輯
單細胞數(shù)據(jù)庫：好用不踩坑的單細胞數(shù)據(jù)庫合集
Nature子刊 | 適用于生物學(xué)研究人員的機器學(xué)習(xí)指南（上）
Nature子刊 | 適用于生物學(xué)研究人員的機器學(xué)習(xí)指南（下）
未完待續(xù)...
