Matlab-常用清洗數(shù)據(jù)命令

  1. 添加路徑+加載數(shù)據(jù)

addpath()
load("XXX.mat")

  1. 數(shù)據(jù)轉置

df = df'

  1. 判斷矩陣中全是0的行或列

na=all(isnan(df),2);
z=find(na==1);
all: 當所有元素為0時返回TRUE

  1. 去掉矩陣某幾個對象

df(z,:)=[]

  1. 臨近填補

df=knnimpute(df);

  1. 格式轉換

num2cell %將double轉成cell
cell2mat %將cell轉成double
string %將cell轉成string
str2double %將string轉成double
cellstr %將string 轉成cell

  1. 查詢某一個元素是否在某一列里面

strcmp(A, B) %查詢B是否在A里

  1. 查找 (R里面的which)

find(target_met==1)

9 查找 方法2

當C完全是A的子集時,能出C能調出B來
map_1 = containers.Map(A,B);
Metab_name = values(map_1,C);

  1. 合并矩陣 (相當于R中的cbind, rbind)

cat(1, n, meta) %1是按照行合并

  1. 創(chuàng)建一組重復數(shù)據(jù)

repmat(6,1,213)
1列,213行,每個數(shù)字都是6

  1. 輸出圖像

set(gif, "Position", [100 100 700 10000])
print(gif, "-dtiff", "heatmap.png", "-r600")

12.對數(shù)據(jù)進行Z矯正(對列矯正)

data=zscore(data)

  1. 同一張圖輸出多個圖像

subplot(3,1,1) %一列,3行,第一個圖像
subplot(3,1,2) %一列,3行,第二個圖像

  1. 在圖像上繼續(xù)加元素

hold on
加完了 hold off

  1. 制作矩陣(全是0)用于循環(huán)的填充

data = zeros(a,b)
a,b 為行和列

  1. 查找矩陣有多少行多少列

size(data,1) #多少行

  1. 查找每列有多少個缺失值

[row,col] = find(isnan(data_mean)==1);
frequency = tabulate(col);
nonan_Meta_Index = find(frequency(:,2)==0);

  1. 創(chuàng)建路徑

mkdir('result/WTob')

  1. 創(chuàng)建存儲cell的對象

All_data = cell(6,1); %6行1列

  1. 一張圖像上畫多個圖

subplot(7,1,i) %7行1列第I個

  1. 輸出圖像比例

pbaspect([1, 1, 1])

  1. 字符串連接

strcat(a,b)

  1. 畫圖參數(shù)

xticks([1:10])
xticklabels(Samplename);
xtickangle(45);

xlabel("log2(Fold change)");
  1. 新建文件夾

mkdir('result/1')

  1. 加載數(shù)據(jù)

load()

  1. 不等于
    ~=

  2. 柱狀圖

histogram(zero_fc,'BinWidth',0.2,'FaceColor','#0072BD')

  1. 畫虛線

plot([1,1],[0,2500],'--k','LineWidth',1)

  1. 散點圖

plot(DEGs_red(:,1),-log10(DEGs_red(:,2)),'.','Color',"r")

30 讀取CSV
data_bio = readtable('EC.csv');
data_bio = table2cell(data_bio);

五天入手matlab,開心
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