按照之前的套路從NCBI上下載SRA序列文件，發(fā)現(xiàn)走不通了
可能是官方推動使用SRA Toolkit，而關(guān)掉了ftp下載路徑

ATTENTION

之前已經(jīng)被師兄警告，不能使用單位服務器的批量下載功能從網(wǎng)上下載大體量文件
所以linux環(huán)境下的命令行操作也不行了

無奈，嘗試在window環(huán)境下使用SRA Toolkit

1、從文獻中獲取數(shù)據(jù)集索引號accession，如 SRP140546 和 SRP201641

2、登錄官網(wǎng)，獲取樣本accession列表和分組文件

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Traces/study/?acc=???

此處用數(shù)據(jù)集accession替換???，下載SRR_Acc_List.txt和metadata

3、下載window版本的Toolkit，解壓到某一路徑

https://github.com/ncbi/sra-tools/wiki/02.-Installing-SRA-Toolkit

4、win + R，進入DOS界面，進入某一路徑

5、執(zhí)行下載命令

your_path\prefecth.exe --type fastq  --option-file your_path\Sra_Acc_List.txt

將fastq格式的序列文件下載到當前路徑