近年來(lái),單細(xì)胞測(cè)序技術(shù)越發(fā)火爆,它在揭示細(xì)胞異質(zhì)性和展示組織內(nèi)真實(shí)細(xì)胞種類(lèi)上獨(dú)有優(yōu)勢(shì)。單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)從單細(xì)胞懸液到單細(xì)胞核懸液,從上門(mén)樣本制備到寄送樣本制備,方式已經(jīng)越來(lái)越多樣化。對(duì)于很多地區(qū)來(lái)說(shuō),可能上門(mén)進(jìn)行樣本制備不是特別適用,對(duì)此多數(shù)都會(huì)采取寄送樣本的方式進(jìn)行制備,今天小編就寄送樣本過(guò)程需要注意的點(diǎn)進(jìn)行了小小的總結(jié),希望對(duì)大家能有所幫助哦!
寄送樣本過(guò)程中的小小建議:
組織保存液寄送新鮮樣本(<48h)
l?組織大小≥0.2 g,常見(jiàn)腫瘤組織優(yōu)先;
l?客戶(hù)將新鮮組織樣本處理成適宜體積(建議指甲蓋大小,去除周邊不需要的組織等)后,直接放入裝有組織保存液的儲(chǔ)存管中。組織盡量無(wú)菌放入液體中,迅速蓋緊加封口膜包裝好。
l?組織樣本應(yīng)完全浸沒(méi)于組織保存液中(組織保存液用之前需2-8℃預(yù)冷);
l?建議首次寄送時(shí)同一樣本2-3管重復(fù),以防萬(wàn)一;
l?客戶(hù)需標(biāo)明:樣本名稱(chēng),組織類(lèi)型,離體時(shí)間,浸入組織保存液時(shí)間;
l?冰袋寄送(注意不要選擇干冰),裝有樣本的儲(chǔ)存管不能和冰袋直接接觸,需用泡沫包裹。務(wù)必保證在 48 小時(shí)內(nèi)到達(dá)實(shí)驗(yàn)室。
注意:組織保存液盡量在1個(gè)月內(nèi)使用,存放在4度冰箱里,不要凍存!
干冰寄送凍存細(xì)胞
l?凍存前細(xì)胞活性80%以上 ;
l?建議首次寄送時(shí)同一樣本2-3管重復(fù),以防萬(wàn)一;
l?凍存方法:將分離的細(xì)胞放到程序降溫盒中(推薦異丙醇凍存盒),然后將程序降溫盒放入到-80℃冰箱,24小時(shí)后干冰寄送或者液氮保存??蓞⒖?0x 官方細(xì)胞凍存方法CG00014_Demonstrated_Protocol_FreshFrozenHumanMouseCellLineMix或者CG00039_Demonstrated_Protocol_FreshFrozenHumanPBMCs(10x官網(wǎng)可下載或者聯(lián)系諾禾銷(xiāo)售或技術(shù)提供);
l?將液氮保存的細(xì)胞凍存管,采用干冰寄送至單細(xì)胞實(shí)驗(yàn)室;
l?細(xì)胞復(fù)蘇后,若細(xì)胞活性≥80%,建議上機(jī) 10x/BD;若細(xì)胞活性<80%,則不建議上機(jī)。
干冰寄送凍存組織抽核
l?客戶(hù)處理組織樣本,一般組織建議?0.2-0.5g/管,處理成黃豆大小,液氮速凍,然后把樣本放入裝有凍存管中保存,建議后續(xù)將凍存管放入凍存盒中??蛻?hù)需標(biāo)明:樣本名稱(chēng),組織類(lèi)型,離體保存時(shí)間;
l?凍存后拿出凍存管,采用干冰寄送(一般?10-20 公斤,根據(jù)運(yùn)輸季節(jié)及距離而定)至實(shí)驗(yàn)室(寄送過(guò)程中保證干冰充足);
l?如樣本量足夠,建議首次寄送同一樣本?2-3 管重復(fù),以作備用;
l?若是對(duì)照課題,建議首次寄送進(jìn)行預(yù)實(shí)驗(yàn),預(yù)實(shí)驗(yàn)確定項(xiàng)目方案后,再進(jìn)行珍貴實(shí)驗(yàn)組的準(zhǔn)備和寄送。預(yù)實(shí)驗(yàn)建議提供測(cè)試樣本盡量全面;
l?若組織不是液氮速凍,而是直接放在干冰上或-80°冰箱速凍,組織 RNA 可能會(huì)略有降解,影響后續(xù)結(jié)果。
溫馨提示
單細(xì)胞懸液的質(zhì)量很大程度取決于樣本本身的狀態(tài),制備過(guò)程可能會(huì)對(duì)基因的表達(dá)有一定影響,而運(yùn)輸凍存等也會(huì)對(duì)脆弱細(xì)胞有一定損傷,因此不建議做細(xì)胞全圖譜的老師選擇此方式,而對(duì)于研究分子機(jī)制的老師較為適用。另外樣本污染可能會(huì)對(duì)后續(xù)數(shù)據(jù)質(zhì)量造成嚴(yán)重影響,一定注意無(wú)菌操作。