軟件文獻(xiàn)https://academic.oup.com/jhered/article/90/4/502/860820
下載直接安裝即可，最新版本version 1.2.02 (16.II.1999)，不知道有沒有其他較新軟件可用，或者軟件只是基于某個(gè)基礎(chǔ)理論供試進(jìn)行計(jì)算的軟件。
軟件里的三個(gè)模型
輸入格式
軟件支持GENEPOP 格式
使用Genalex 可將Genalex可讀格式轉(zhuǎn)換為GENEPOP 格式，使用Genalex導(dǎo)出
軟件界面
add date file 導(dǎo)入轉(zhuǎn)換后GENEPOP 格式，選擇變異模型 ，Go 即可
由于SSR位點(diǎn)的數(shù)量及數(shù)量限制選擇不同的 mutation model,
少于20個(gè)位點(diǎn)使用 Wilcoxon’s test is the most appropriate
and powerful.
使用TPM
For most mi-crosatellites, the
TPM (two-phase model)is apparently even more appropriate than
the
SMM
When using microsatellites we recom-
mend the TPM with 95% single-step mu-
tations and 5% multiple-step mutations
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不知道對(duì)不同突變模型的中文是什么。
SMM one-step stepwise mutation model 逐步突變模型，或單步突變模型
IAM: infinite allele model 無限等位基因模型， 或
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以下論文
[1]楊勝林,徐龍?chǎng)?楊海兵,李愛萍.中國(guó)5個(gè)矮馬品種的瓶頸效應(yīng)分析[J].中國(guó)畜牧獸醫(yī),2013,40(01):140-144.
位點(diǎn)多余20 使用 standardized differences test
少于20 使用 Wilcoxon’s test
現(xiàn)在是理解結(jié)果文件,結(jié)果文件是按不同群體進(jìn)行劃分內(nèi)容的，一個(gè)群體一部分，群體內(nèi)計(jì)算的是不同TEST下的不同模型的一些情況
