學習筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學<br>
IP屬地：黑龍江
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基于Vcf文件進行基因單倍型分析單倍型，是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡稱，在遺傳學上是指...
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R繪圖|pheatmap熱圖繪制——高階篇
繪圖場景：在高通量檢測數(shù)據(jù)中，我們在數(shù)據(jù)展示上往往都喜歡將感興趣的功能或者通路基因繪制成熱圖形式，能夠讓讀者一目了然的發(fā)現(xiàn)某功能是增強了？還是減弱了？在實際過程中，表型實驗上...
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運用 R語言 pheatmap 包繪制熱圖進階部分pheatmap包來顯示行或列的分組信息 行或列的分組注釋信息 在EXCEL中整理好樣本和物種的注釋信息，當然這個需要依據(jù)你的具體需求來確定。 對樣本的注釋信息，比如這里用到...
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R繪制熱圖（pheatmap）熱圖可以反應(yīng)各個樣本的基因分布情況，把數(shù)字轉(zhuǎn)換成圖片更直觀一些，目前畫熱圖的軟件不少，比如graphpad，華科也出了一款軟件，甚至excel都可以，還有很多在線熱圖工具，但...
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使用GEMMA進行GWAS分析
GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件。相比較...
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用ropls進行代謝組PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析簡介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對變量數(shù)超過樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學數(shù)據(jù)進行可視化、回歸、分類和特征選擇的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...
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R繪圖_熱圖包pheatmappheatmap，全稱Pretty Heatmaps，直譯“完美的熱圖”，是一款非常優(yōu)秀的熱圖繪制R包。網(wǎng)上也有很多可供參考的教程[1][2]，在初學R后，我也曾寫過了一篇教...
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數(shù)據(jù)處理，分析與展現(xiàn)，R語言編程，Python, 圖表制作，基于數(shù)據(jù)的決策與執(zhí)行,算法。Life is short, use Linux.
