請問，多個屬多個物種單拷貝同源基因建樹時，保證每個單拷貝同源基因都至少60%樣本比例，那串聯(lián)時，樣本里那些沒有的基因怎么辦？是直接“——————”代替嗎？
如何輕松構(gòu)建物種系統(tǒng)發(fā)育樹在常規(guī)的基因組分析中，當我們對某一物種的基因組進行從頭組裝與注釋獲得其的基本信息后，通常會想知道該物種與一些其他近源物種之間的進化關(guān)系，此時就需要構(gòu)建不同物種之間的系統(tǒng)發(fā)育樹...
有沒有人知道，KeyError: 'Unknown INFO field: ANN'
這個bug怎么改啊
我的vcf沒有ANN啊
CHROM POS ID REF ALT QUAL FILTER INFO FORMAT sample1 sample2 sample3 ……
用snpEff產(chǎn)出的vcf提取4DTv位點，構(gòu)建進化樹用snpeff產(chǎn)出的vcf提取4DTv位點，用于構(gòu)建進化樹 轉(zhuǎn)載自https://blog.csdn.net/u012110870/article/details/1055...
昨天發(fā)現(xiàn)了神器multiqc來整合分析一個目錄下所有文件的quality control結(jié)果，今天來試著裝了一下。 然后又發(fā)現(xiàn)了conda這個使得生活更美好的package ...
樓主，你好。
我用自己的數(shù)據(jù)snp—甲基化數(shù)據(jù)做了 MatrixEQTL，生成的圖 plot(me)很奇怪。不管是什么模型，都是梯形上升。不是對角線的…… 請問我這種是不是數(shù)據(jù)不是正態(tài)分布的原因？
多組學(xué)聯(lián)合分析-Matrix eQTL找到Matrix eQTL這個包，看下文章Matrix eQTL: ultra fast eQTL analysis via large matrix operations（...
