作者:二十八畫生審稿:童蒙編輯:amethyst 引言 經(jīng)常看到類似的提問:轉(zhuǎn)錄組測序分析中FPKM和TPM哪個歸一化方法好?小編并不盲從,此前一直使用FPKM,Nature...
回顧 首先對基因表達分析(上)做一個簡單的回顧 研究基因表達的有如下工具:RNA-Seq,microarray, qRT-PCR等(歡迎補充) RNA-Seq,microar...
我是在找snakemake參考資料的時候找到的這本在線電子書,鏈接是 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/[http...
轉(zhuǎn)錄組學(Transcriptomics),是一門在真整體水平上研究細胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學科,從RNA水平研究基因的表達情況。轉(zhuǎn)錄組測序是通過二代測序平臺快速...
測序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測序從raw reads到表達矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測序pipeline:從raw r...
前面在講GO和KEGG富集倍數(shù)(Fold Enrichment)如何計算[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin....
what is Gene Ontology ?——基因本體論 1 , 什么是本體論?簡單來說,就是我們對一個具體事物進行分類并予以描述。例如:貓是一種哺乳動物/貓是貓科動物/...
轉(zhuǎn)錄組學習一(軟件安裝) 轉(zhuǎn)錄組學習二(數(shù)據(jù)下載) 轉(zhuǎn)錄組學習三(數(shù)據(jù)質(zhì)控) 轉(zhuǎn)錄組學習四(參考基因組及gtf注釋探究) 轉(zhuǎn)錄組學習五(reads的比對與samtoo...
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lz從今天開始希望跟大家分享一些生信的實戰(zhàn),希望與大家一起進步,前段時間應老板的要求自學的轉(zhuǎn)錄組的拼接原理,經(jīng)過一番折騰,最終在超算平臺的幫助下完成了老板交給的任務。 ...
劉小澤寫于18.11.25每學習一遍之前的知識,總能從不同角度獲取一些觀點,然后擴增自己的知識庫,這就是“知識迭代”這次我也就是想到哪寫到哪,把自己認為重要的內(nèi)容梳理下,用Q...
這次是分享李婧翌團隊的一篇綜述《Modeling and analysis of RNA-seq data: a review from a statistical pers...