作者:二十八畫生審稿:童蒙編輯:amethyst 引言 經(jīng)常看到類似的提問(wèn):轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中FPKM和TPM哪個(gè)歸一化方法好?小編并不盲從,此前一直使用FPKM,Nature...
作者:二十八畫生審稿:童蒙編輯:amethyst 引言 經(jīng)常看到類似的提問(wèn):轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析中FPKM和TPM哪個(gè)歸一化方法好?小編并不盲從,此前一直使用FPKM,Nature...
回顧 首先對(duì)基因表達(dá)分析(上)做一個(gè)簡(jiǎn)單的回顧 研究基因表達(dá)的有如下工具:RNA-Seq,microarray, qRT-PCR等(歡迎補(bǔ)充) RNA-Seq,microar...
我是在找snakemake參考資料的時(shí)候找到的這本在線電子書,鏈接是 https://eriqande.github.io/eca-bioinf-handbook/[http...
轉(zhuǎn)錄組學(xué)(Transcriptomics),是一門在真整體水平上研究細(xì)胞中基因轉(zhuǎn)錄的情況及轉(zhuǎn)錄調(diào)控規(guī)律的學(xué)科,從RNA水平研究基因的表達(dá)情況。轉(zhuǎn)錄組測(cè)序是通過(guò)二代測(cè)序平臺(tái)快速...
測(cè)序上游分析系列: mRNA-seq轉(zhuǎn)錄組二代測(cè)序從raw reads到表達(dá)矩陣:上中游分析pipelinemiRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline:從raw r...
前面在講GO和KEGG富集倍數(shù)(Fold Enrichment)如何計(jì)算[https://link.zhihu.com/?target=http%3A//mp.weixin....
what is Gene Ontology ?——基因本體論 1 , 什么是本體論?簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),就是我們對(duì)一個(gè)具體事物進(jìn)行分類并予以描述。例如:貓是一種哺乳動(dòng)物/貓是貓科動(dòng)物/...