本想注銷賬號(hào),后來隨便翻了翻,還是沒舍得。簡書曾讓我投入了很多感情,碼文章也占用了我很多時(shí)間,就像自己養(yǎng)大的花一樣,不是隨便就能掐死的。停更大概一年了,主要原因是認(rèn)識(shí)到自己有...
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一個(gè)小技巧 可以把這個(gè)gdc-client 文件放到可bin 目錄下,再添加到環(huán)境變量,不用每次把這個(gè)下載器放到文件夾中運(yùn)行。
4ca2293f4a7b 評(píng)論自從官網(wǎng)上下載TCGA數(shù)據(jù)
日式鍵盤和傳統(tǒng)的美式鍵盤鍵位不一樣,打出的符號(hào)是錯(cuò)的。找了一個(gè)下午,把windows注冊(cè)表全改了一遍。 操作系統(tǒng):win10鍵盤:Realforce 第一步 修改鍵盤驅(qū)動(dòng) w...
更了,來看吧~
火山圖新畫法整理思路:先畫出中間的火山圖,再畫左右兩張放大版的圖,最后用AI將三張圖拼接到一起,鋼筆工具畫出中間連接的小T形,同色的小矩形把連接處的實(shí)線蓋住,打造出一種藕斷絲連的神秘感(...
整理思路:先畫出中間的火山圖,再畫左右兩張放大版的圖,最后用AI將三張圖拼接到一起,鋼筆工具畫出中間連接的小T形,同色的小矩形把連接處的實(shí)線蓋住,打造出一種藕斷絲連的神秘感(...
@凌云月 謝大佬
好用的TCGA可視化網(wǎng)站如果我們想看某基因在某癌癥中表達(dá)量變化,就不需要費(fèi)那么大勁清洗數(shù)據(jù)了,直接找一個(gè)好用的可視化網(wǎng)站就可以了。GEPIA:http://gepia.cancer-pku.cn/i...
??力做日更小能手
heatmap繪制整理出這樣的group和表達(dá)譜數(shù)據(jù),其中表達(dá)譜必須是矩陣 為熱圖上方的bar賦值 annotation_col = data.frame(Gender = group)row...
R語言函數(shù)如何返回多個(gè)值 問題 之前想嘗試一下使用perl中的或者python風(fēng)格的方式來寫R的函數(shù)的時(shí)候,想返回兩個(gè)參數(shù) 于是就這樣寫了: 運(yùn)行一下 結(jié)果 報(bào)錯(cuò)了,之前的那...
整理出這樣的group和表達(dá)譜數(shù)據(jù),其中表達(dá)譜必須是矩陣 為熱圖上方的bar賦值 annotation_col = data.frame(Gender = group)row...
Q:該如何選擇limma, DESeq2, edgeR A:各有各自應(yīng)用的場景 如果是芯片數(shù)據(jù),一般選擇limma,畢竟它是處理芯片數(shù)據(jù)之王。 不過edgeR也可以。芯片數(shù)據(jù)...
加載包 library(TCGAbiolinks)library(dplyr)library(DT)library(SummarizedExperiment) 下載臨床數(shù)據(jù) ...
最近學(xué)習(xí)了生信菜鳥團(tuán)的純R代碼實(shí)現(xiàn)ssGSEA算法評(píng)估腫瘤免疫浸潤程度,想復(fù)制作者的流程,但是發(fā)現(xiàn)了幾個(gè)不一樣的地方,所以重新整理流程,代碼主要來自原作者Juan_NF。 文...
@生信技能樹
ddl是最大生產(chǎn)力
Matlab-常用清洗數(shù)據(jù)命令添加路徑+加載數(shù)據(jù) addpath()load("XXX.mat") 數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)置 df = df' 判斷矩陣中全是0的行或列 na=all(isnan(df),2);z=fin...