學(xué)習(xí)筆記<br>研究方向: 植物群體遺傳學(xué)<br>
IP屬地：陜西
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基于Vcf文件進(jìn)行基因單倍型分析單倍型，是單倍體[https://baike.baidu.com/item/%E5%8D%95%E5%80%8D%E4%BD%93/304058]基因型的簡(jiǎn)稱(chēng)，在遺傳學(xué)上是指...
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研究生一枚，主要研究方向?yàn)橹参飪?nèi)生菌及微生物相關(guān)內(nèi)容，公眾號(hào)【科研后花園】，主要更新內(nèi)容：1）基于R的科研繪圖；2）科研小技巧分享；3）繪圖技巧分享；4）科研網(wǎng)站分享。
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R繪圖|pheatmap熱圖繪制——高階篇
繪圖場(chǎng)景：在高通量檢測(cè)數(shù)據(jù)中，我們?cè)跀?shù)據(jù)展示上往往都喜歡將感興趣的功能或者通路基因繪制成熱圖形式，能夠讓讀者一目了然的發(fā)現(xiàn)某功能是增強(qiáng)了？還是減弱了？在實(shí)際過(guò)程中，表型實(shí)驗(yàn)上...
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運(yùn)用 R語(yǔ)言 pheatmap 包繪制熱圖進(jìn)階部分pheatmap包來(lái)顯示行或列的分組信息 行或列的分組注釋信息 在EXCEL中整理好樣本和物種的注釋信息，當(dāng)然這個(gè)需要依據(jù)你的具體需求來(lái)確定。 對(duì)樣本的注釋信息，比如這里用到...
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R繪制熱圖（pheatmap）熱圖可以反應(yīng)各個(gè)樣本的基因分布情況，把數(shù)字轉(zhuǎn)換成圖片更直觀一些，目前畫(huà)熱圖的軟件不少，比如graphpad，華科也出了一款軟件，甚至excel都可以，還有很多在線熱圖工具，但...
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中國(guó)科學(xué)院新疆生態(tài)與地理研究所，碩士生導(dǎo)師，招生專(zhuān)業(yè)：生態(tài)學(xué)、自然地理學(xué)
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使用GEMMA進(jìn)行GWAS分析
GEMMA（Genome-wide Efficient Mixed Model Association algorithm）是一款基于混合線性模型的GWAS分析軟件。相比較...
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用ropls進(jìn)行代謝組PCA, PLS, PLS-DA, OPLS, or OPLS-DA分析簡(jiǎn)介 主成分分析(PCA)和偏最小二乘法(PLS)是對(duì)變量數(shù)超過(guò)樣本數(shù)量或變量之間存在多重共線性的組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行可視化、回歸、分類(lèi)和特征選擇的常用方法。 PLS和正交偏最小二乘...
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R繪圖_熱圖包pheatmappheatmap，全稱(chēng)Pretty Heatmaps，直譯“完美的熱圖”，是一款非常優(yōu)秀的熱圖繪制R包。網(wǎng)上也有很多可供參考的教程[1][2]，在初學(xué)R后，我也曾寫(xiě)過(guò)了一篇教...
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岳衡，一名在讀博士，在「半山拾夢(mèng)」記錄科研與思考的日常。生命不息，折騰不止。
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數(shù)據(jù)處理，分析與展現(xiàn)，R語(yǔ)言編程，Python, 圖表制作，基于數(shù)據(jù)的決策與執(zhí)行,算法。Life is short, use Linux.
