1使用cell ranger拆分10X單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組原始數(shù)據(jù) 比較詳細(xì)，從頭開始講的 2實(shí)驗(yàn)記錄1：安裝Cellranger與Seurat，下載數(shù)據(jù) 3實(shí)驗(yàn)記錄2：Cellra...
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Cell Ranger教程資料整理（初）
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SRA數(shù)據(jù)庫及其數(shù)據(jù)的下載（GEO、SRA）
SRA數(shù)據(jù)庫 Sequence Read Archive (SRA)是NCBI旗下的數(shù)據(jù)庫之一，其作用是存儲包括Illumina、454、IonTorrent、Complet...
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windows系統(tǒng)下載NCBI的SRA序列文件
按照之前的套路從NCBI上下載SRA序列文件，發(fā)現(xiàn)走不通了可能是官方推動使用SRA Toolkit，而關(guān)掉了ftp下載路徑 之前已經(jīng)被師兄警告，不能使用單位服務(wù)器的批量下載功...
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2019-10-22 R語言Seurat包下游分析-1下游分析 cellranger count 計(jì)算的結(jié)果只能作為錯略觀測的結(jié)果，如果需要進(jìn)一步分析聚類細(xì)胞，還需要進(jìn)行下游分析，這里使用官方推薦 R 包（Seurat 3.0）...
