燕麥（Avena sativa）作為谷物中最好的全價(jià)營(yíng)養(yǎng)食品，因其富含蛋白質(zhì)、不飽和脂肪酸以及可溶性膳食纖維而廣受消費(fèi)者青睞。同時(shí)，栽培燕麥?zhǔn)橇扼w作物，它在生物量、活力和對(duì)...
發(fā)簡(jiǎn)信
IP屬地：上海
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基因組文章 | 2022《Nature Genetics 》六倍體栽培燕麥的起源與進(jìn)化 -
2018-09-22 WES文獻(xiàn)閱讀3wes文獻(xiàn)抄讀3 Title：Whole-exome sequencing reveals the origin and evolution of hepato-cholan...
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全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)分析（下）
作者：Arno審稿：童蒙編輯：angelica 前面我們介紹了PacBio三代全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序相關(guān)的全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本鑒定、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本比對(duì)、全長(zhǎng)轉(zhuǎn)錄本結(jié)構(gòu)分析上篇。 今天我們繼續(xù)介紹包...
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miRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測(cè)新miRNA，到表達(dá)矩陣【一】該教程分為2部分，第2部分在：miRNA-seq小RNA高通量測(cè)序pipeline：從raw reads，鑒定已知miRNA-預(yù)測(cè)新miRNA，到表達(dá)矩陣【二】 因?yàn)橹芭龅?..
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點(diǎn)點(diǎn)滴滴的瑣碎/迭代更新著意識(shí)
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(效率人生)程序員必備工具Dash作為一名程序員，每天最常見(jiàn)的動(dòng)作就是查看各種API文檔，你一定也有過(guò)同時(shí)打開(kāi)N個(gè)窗口（HTML、PDF、CHM），不停的在編輯器與文檔之間切換。不僅消耗時(shí)間，而且效率也低。各...
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非常實(shí)用的 Python 庫(kù)，推一次火一次！推薦：Python全棧教程！花了29980買的從入門到精通課程，分享給大家[https://www.bilibili.com/video/BV1YZ4y197RY] Pyth...
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生信6--SAM和blasttab+過(guò)濾一樣的結(jié)果
我在處理數(shù)據(jù)的時(shí)候發(fā)現(xiàn)sam文件和blasttab+文件排序不同sam文件是按照reference里面的名字排序的，而blasttab+是從高到低排序的 因?yàn)槲野l(fā)現(xiàn)在過(guò)濾轉(zhuǎn)化...
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生信5--python多線程multiprocessing模塊
用multiprocessing模塊來(lái)多線程from multiprocessing import Process 先用列表建立一堆Process對(duì)象run_SNP_modu...
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生信4--用python將blasttab+格式文件和fasta文件寫(xiě)成class對(duì)象并給予方法
blasttab+結(jié)果寫(xiě)成class先每一行解析一下 發(fā)現(xiàn)不是很方便，那就把每一行形成一個(gè)列表寫(xiě)成類對(duì)象，用了pandas模塊方便一點(diǎn) 這樣，運(yùn)行下面代碼 然后把結(jié)果解析成L...
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生信3--使用python搭建生信流程之python交互式運(yùn)行本地化blastn
最近正好用python重新搭建流程，就展示一下python和Linux系統(tǒng)的互動(dòng)os是operating system（操作系統(tǒng)）的縮寫(xiě)，所以Python的os模塊封裝了常見(jiàn)...
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生信2--利用Biopython解析genebank格式文件Ncbi下載的文件很多是注釋完的Genebank格式文件，如果只有一個(gè)菌株的全基因組注釋還能人工通過(guò)查刪改，如果是一個(gè)文件含有大量的菌株，就要自動(dòng)化解析了。 如果只有一條記錄...
