0. 簡(jiǎn)介 這篇文章是來(lái)自于明尼蘇達(dá)大學(xué)的Chad L. Myers在The Plant Cell發(fā)表的關(guān)于整合共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)與GWAS來(lái)挖掘玉米中的causal genes.文...
IP屬地：澳門
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Integrating Coexpression Networks with GWAS to Prioritize Causal Genes in Maize -
細(xì)胞類型鑒定--單細(xì)胞marker基因（持續(xù)修正）細(xì)胞類型marker基因T CellsCD3D, CD3EThCD3D, CD3E, CD40LGTcCD3D, CD3E, CD8A, CD8BgdTTRDV2, TRGV...
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基因芯片 尋找探針?biāo)鶎?duì)應(yīng)的基因ID最近在學(xué)習(xí)處理芯片數(shù)據(jù)，遇到一個(gè)問(wèn)題就是芯片數(shù)據(jù)和基因ID之間的對(duì)應(yīng)問(wèn)題。不然感覺(jué)自己做出的東西沒(méi)有辦法分析。 先來(lái)看一下芯片探針與基因直接的關(guān)系： ·探針組與基因關(guān)系：...
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單細(xì)胞分辨率下腎細(xì)胞癌和微環(huán)境的多區(qū)域表征[10X單細(xì)胞聯(lián)合10XVDJ分析、Mutation Calling]hello，大家好，我們的分析也慢慢進(jìn)入深水區(qū)了，很多方法需要聯(lián)合起來(lái)使用，如何靈活運(yùn)用各種方法，就需要我們的經(jīng)驗(yàn)和智慧了。今天分享的文獻(xiàn)在Multi-regional ch...
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熱圖2：分組聚類，讓熱圖分裂還記得之前我們發(fā)過(guò)的熱圖嗎？ 樣品之間聚類的時(shí)候發(fā)現(xiàn)對(duì)照和實(shí)驗(yàn)組混合到了一起。這是由于樣品一致性差造成的，這種情況很多時(shí)候都會(huì)遇到。一般的做法是放棄列的聚類。但是我不，很多文...
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ComplexHeatmap熱圖繪制 | 指定基因在熱圖中標(biāo)記如想獲得圖例代碼和數(shù)據(jù)，請(qǐng)到公眾號(hào)“小杜的生信筆記”中回復(fù)“20220117”，鏈接有效期2022.17-2022.2.17（特別申明：該數(shù)據(jù)僅是演示數(shù)據(jù)，無(wú)任何意義） 教程...
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10X單細(xì)胞空間聯(lián)合表征腎細(xì)胞癌與其微環(huán)境周五了，一周的收官之戰(zhàn)，我們繼續(xù)分享單細(xì)胞空間聯(lián)合分析的內(nèi)容，這一篇我們參考的文章在Multi-regional characterisation of renal cell...
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不好好做圖的NSC系列(七):跟著cell學(xué)習(xí)用散點(diǎn)圖展示韋恩圖的效果
好久不見(jiàn)！ 今天我們重復(fù)和學(xué)習(xí)這篇cell文章的Figure 3D。仔細(xì)看圖，這個(gè)散點(diǎn)圖表示的是兩種細(xì)胞中上調(diào)的基因，很明顯散點(diǎn)作圖用的是基因Log2FC做的。再仔細(xì)看看，這...
