1.默認(rèn)安裝v4版本 2.因?yàn)橛袀€(gè)去批次的R包（iSMNN）需要安裝V3版本的Seurat，所以我需要安裝Seurat v3版本但是在此過程中一直在報(bào)錯(cuò)： 發(fā)現(xiàn)只有spats...
IP屬地：寧夏
-
Seurat v3版本安裝
-
單細(xì)胞ChIP-seq方法的比較寫在前面的廢話 這篇文章來自于一個(gè)舔狗的悲哀，謹(jǐn)以此文告訴大家莫當(dāng)舔狗…… 以上聊天記錄，就是整個(gè)故事背景。當(dāng)時(shí)我的內(nèi)心歷程： 我看過類似的文章欸，趕緊發(fā)出來展現(xiàn)一下我的閱讀...
-
centos7非root安裝各種依賴庫(kù)(舉一反三)在安裝cytoTRACE的時(shí)候，除了之前所需要的更高版本的GCC，此外，它還需要nc-config這個(gè)依賴庫(kù)，這在我們組服務(wù)器也是沒有的，在沒有root權(quán)限下，我們?cè)撊绾伟惭b...
-
R語(yǔ)言中如何在Mac下快速下載和安裝包
一.安裝R包的方式： 由于R包發(fā)布在cran上的包非常嚴(yán)格所以很多功能強(qiáng)大的包并不能直接在cran上下載到--也就是說用 install.package 命令無法下載，這是后...
-
2020-03-20 人心臟發(fā)育過程中全器官的基因表達(dá)和細(xì)胞圖譜一句話總結(jié)：利用空間轉(zhuǎn)錄方法在單細(xì)胞分辨率下探索人類心臟發(fā)育的基因表達(dá)圖景，以構(gòu)建一個(gè)3D器官范圍的圖譜。 Highlights Profiled spatiotempora...
-
SingleR輔助注釋單細(xì)胞很多做單細(xì)胞的研究者都提出過這個(gè)問題，是否有直接的功能能對(duì)單細(xì)胞直接進(jìn)行注釋，而不是繁瑣的參看文獻(xiàn)，搜索marker，人為對(duì)單細(xì)胞進(jìn)行注釋。單細(xì)胞真的可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化注釋嗎？我...
-
單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組功能分析（超詳細(xì)clusterProfiler,GSEA,GSVA分析）單細(xì)胞分析不可避免的會(huì)涉及到鑒定不同細(xì)胞類型的功能或比較相同類型在不同狀態(tài)下的功能差異，因此，功能分析在單細(xì)胞分析中相當(dāng)重要. 功能分析的方法很多，這兒我們主要講述3種功能分...
-
2020-08-28 SingleR v1.2.4單細(xì)胞自動(dòng)注釋軟件首先SingleR屬于不基于Prior Knowledge的注釋方法；相對(duì)應(yīng)的還有基于Prior Knowledge的方法，比如CellAssign，但兩個(gè)用起來都不是很順手...
