sratoolkit 是NCBI提供的用于處理來自SRA 數(shù)據(jù)庫測序數(shù)據(jù)的一個工具包。 #1. sratoolkit 配置 #1.1 srato...
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SRA Toolkit - prefetch 快速下載NCBI SRA數(shù)據(jù) -
在線畫圖平臺千千萬，總有一款適合你人人都想畫出好看的圖來展示成果，如果你沒有編程基礎(chǔ)，各大公司的云平臺基本可以滿足大部分需求或者找人幫忙，如果你是大牛，可以自己寫個小工具個性化定...
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其實MCScan畫圖也可以很好看最近發(fā)現(xiàn)了python版的MCScan，是個大寶藏。由于走了不少彎路，終于畫出美圖，趕緊記錄下來 github地址 https://github...
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省心省事的植物miRNA分析軟件miR-PREFeR,值得擁有最近在做某個植物小物種的miRNA分析，看過幾個公司的miRNA分析報告和文獻(xiàn)后開始動手。大概分以下幾步：1、篩選出目標(biāo)miRNA(a)根據(jù)長度...
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值得收藏——10個蛋白結(jié)構(gòu)分析預(yù)測和相關(guān)信號轉(zhuǎn)導(dǎo)網(wǎng)站上期小編給大家介紹了疾病與基因突變相關(guān)的數(shù)據(jù)庫，今天小編為大家介紹幾個與基因產(chǎn)物——蛋白質(zhì)相關(guān)的幾個網(wǎng)站，希望對大家有所幫助，感興趣的小伙伴可以...
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當(dāng)我們在說RNA-seq reads count標(biāo)準(zhǔn)化時，其實在說什么？基因表達(dá)標(biāo)準(zhǔn)化Normalisation 我們在比較不同樣品不同基因的差異表達(dá)情況時，期望表達(dá)水平分布符合統(tǒng)計方法的基本假設(shè)，但由于測序深度和基...
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edgeR中三種標(biāo)準(zhǔn)化方法TMM\UQ\RLE的比較關(guān)于RNA-seq中的reads count標(biāo)準(zhǔn)化處理的方法匯總，請先看看這篇：當(dāng)我們在說RNA-seq reads count標(biāo)準(zhǔn)化時，其實在...
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如何輸出列表中的指定列？
最新更新：最簡單的方法還是R 一句話d <-data1[,data2$Header] （data1就是這里的1.txt, data2就是2...
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生物忍者bioninja：快刀斬獲生物學(xué)基礎(chǔ)知識越是學(xué)到后面，越認(rèn)同基礎(chǔ)知識四兩撥千斤的重要性。啃英文原著大部頭如果有些困難的話，可以試試這個網(wǎng)站bioninja，快速補(bǔ)齊基礎(chǔ)知識，高中到研究...
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超好用的PubMed文獻(xiàn)查找管理插件—ScholarscopeScholarscope是17年下半年推出的一款更快，更穩(wěn)定的科研工具。它可以自動加載Pubmed期刊的影響因子，幫助用戶篩選信息，并添加基于S...
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