安裝配置conda 使用清華源下載sh腳本并安裝 下載完成后直接運行腳本文件bash Miniconda3-latest-Linux-x86_6...
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轉(zhuǎn)錄組RNA-SEQ上游分析2020 -
使用STAR構(gòu)建基因組比對索引--問題及解決方法來吧，生信搞起！ 首先拿到公司給的cleandata，使用STAR進行參考基因組比對，軟件安裝參考其他網(wǎng)站給的步驟； 下面是在建索引時遇到的問題...
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比對軟件STAR【更新】STAR下載地址https://github.com/alexdobin/STAR[https://github.com/alexdobin/S...
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比對軟件STAR的使用
在之前的學習和練習里，比對這一步我使用過bowtie2（DNA比對）和hisat2（RNA-seq比對），現(xiàn)在學習另一個很火的軟件：STAR。S...
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高通量測序數(shù)據(jù)處理學習記錄（零）：NGS分析如何選擇合適的參考基因組和注釋文件前言 現(xiàn)有比對工具在做mapping之前，都需要下載對應物種的參考基因組做index，而如何選擇合適的參考基因組是一件非常重要的事情。 現(xiàn)有的參...
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RNA-seq：轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析處理（上）（2019/05/07更新）
superqun原創(chuàng) 一、流程概括 RNA-seq的原始數(shù)據(jù)（raw data）的質(zhì)量評估 linux環(huán)境和R語言環(huán)境 raw data的過濾和...
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RNAseq教程(1.3)
目錄 1.Module 1 - Introduction to RNA sequencing Installation[https://www....
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從下載數(shù)據(jù)開始完整跑hisat2-stringtie-提取表達矩陣參考文章：http://www.itdecent.cn/p/1f5d13cc47f8https://davetang.org/muse/201...
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RNA-seq完整分析過程linux基本命令 第六章 Linux文件與目錄管理 極客學院服務器 高通量相關(guān)基礎知識 生信一百講 1、 Anaconda Anaconda是...
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