生存模型的構(gòu)建方法包括：1. Lasso回歸；2. Cox多因素回歸；3. 隨機森林；4. 支持向量機 可以把log_rank_test或cox...
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TCGA生存模型的構(gòu)建以及模型預測和評估 -
單細胞SCENIC分析原理和流程介紹SCENIC官網(wǎng)：https://rawcdn.githack.com/aertslab/SCENIC/701cc7cc4ac762b91479...
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Seurat的打分函數(shù)AddMouduleScore在讀張澤民老師發(fā)表的新冠文獻的時候看到計算免疫細胞的cytokine score或inflammatory score使用了Seurat包的Ad...
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單細胞量化代謝活性-scMetabolism一、scMetabolism的安裝 scMetabolism是一個R包，用于在單細胞分辨率下量化代謝活性，目前只適用于物種是人的單細胞數(shù)據(jù)。作者...
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單細胞之富集分析-4：分組水平GSVA單細胞富集分析系列： 單細胞之富集分析-1：單細胞GSEA分析流程[http://www.itdecent.cn/p/00f069cb239c...
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使用scRepertoire包進行單細胞免疫組庫數(shù)據(jù)分析簡介 scRepertoire包是由華盛頓大學的Nick Borcherding博士開發(fā)，是一款針對10X V(D)J數(shù)據(jù)的免疫組庫分析工具。它...
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桑基圖在單細胞數(shù)據(jù)探索中的應用什么是?；鶊D ?；鶊D（Sankey diagram），即?；芰糠至鲌D，也叫?；芰科胶鈭D。它是一種特定類型的流程圖，圖中延伸的分支的寬度對應數(shù)...
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Seurat Weekly NO.2 || 我該如何取子集？Seurat Weekly NO.0 || 開刊詞Seurat Weekly NO.1 || 到底分多少個群是合適的？！ 在過去的一周里Seur...
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Seurat包合并多個單細胞樣本示例數(shù)據(jù)：GSE139324有63個samples。https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi...
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scRNA-seq數(shù)據(jù)分析 || Monocle3同系列文章： sc-RAN-seq 數(shù)據(jù)分析||Seurat新版教程:Guided Clustering Tutorial[https://ww...
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