劉小澤寫于19.10.11跟著Bioconductor的教程學(xué)習(xí)一下ChIPpeakAnno的基本流程 前言 官網(wǎng)教程在：https://www...
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學(xué)習(xí)一下ChIPpeakAnno(一) -
ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析)在實(shí)踐之前，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識(shí)點(diǎn)：（參考文章：http://www.itdecent.cn/p/8aca72809c5c） 組...
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ChIP-Seq數(shù)據(jù)挖掘系列-1: Motif 分析(1) - HOMER 安裝
HOMER 是一套用于Motif查找和二代數(shù)據(jù)分析的工具。HOMER 中的工具是使用Perl 和C++編寫的，適用于unix操作系統(tǒng)?；趍ot...
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我的ChIP-Seq(4):MAnorm差異分析哈哈，搜了一圈沒發(fā)現(xiàn)網(wǎng)上有關(guān)于MAnorm的中文教程或者是說明，本文將是第一篇~撒花??ヽ(°▽°)ノ?那就要用心寫了，感到鴨梨.jpg== 首...
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BED 文件格式
BED (Browser Extensible Data)格式文件就是通過規(guī)定行的內(nèi)容來展示注釋信息 BED文件每行至少包括chrom，chro...
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如何使用deeptools處理BAM數(shù)據(jù)如何使用deeptools處理BAM數(shù)據(jù) 總體介紹 deeptools是基于Python開發(fā)的一套工具，用于處理諸如RNA-seq, ChIP-...
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ChIP-seq簡介在B站上找到一個(gè)介紹ChIP-seq的視頻：A gentle introduction to ChIP-Seq。 ChIP-seq用于鑒定能被某...
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bam文件的可視化（測(cè)序深度） | IGV
寫在前面 沒有系統(tǒng)地學(xué)過生信，當(dāng)時(shí)靠著導(dǎo)師的“威逼”，在學(xué)長的指導(dǎo)下學(xué)了perl，然后開始了邊學(xué)邊用的生信路程。 回頭去看，才意識(shí)到基礎(chǔ)有多不扎...
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ChIP-seq基礎(chǔ)入門理解ChIP-Seq 到了目前這個(gè)水平，我學(xué)習(xí)新的高通量數(shù)據(jù)分析流程時(shí)已經(jīng)不再考慮代碼應(yīng)該如何寫的問題了。我更多要去考慮一個(gè)技術(shù)的目的和意義。 ...
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RNA-seq(2)-1:原始數(shù)據(jù)下載的幾種方法
How to download All Sra data At Once SRA: Sequence Read Archive: It bel...
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