環(huán)形RNA是一類在真核生物中廣泛存在的具有特殊環(huán)狀結(jié)構(gòu)的非編碼RNA分子。已有文獻(xiàn)表明，在生物體內(nèi)，環(huán)形RNA有著miRNA海綿、RBP海綿以及...
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【circRNA】circRNA的定量-CIRIquant篇 -
【circRNA】circRNA鑒定-find_circ篇Find_circ工具是最早利用高通量測(cè)序數(shù)據(jù)預(yù)測(cè)環(huán)狀RNA的開山鼻祖。該工具是Memczak等人2013年在權(quán)威Nature雜志上發(fā)表題為“C...
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【circRNA】circRNA鑒定-CIRCexplorer2篇今天測(cè)試另一個(gè)環(huán)狀RNA預(yù)測(cè)的重要軟件——CIRCexplorer2。該軟件是由中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所陳玲玲研究...
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【circRNA】circRNA鑒定-CIRI2篇circRNA的生信分析根據(jù)鑒定的方法不同可以分為以下兩種： split-alignment-based approaches：針對(duì)內(nèi)含子驅(qū)動(dòng)模...
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【circRNA】circRNA的鑒定通過spliced reads的mapping能發(fā)現(xiàn)線性RNA和環(huán)狀RNA的剪切方式不同。一個(gè)是正常的5’/3’前后剪切，一個(gè)是反向的5’/3’...
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【circRNA】circRNA的后期驗(yàn)證隨著去除核糖體測(cè)序技術(shù)深入發(fā)展，越來越多的環(huán)狀RNA（circRNA）不斷報(bào)道發(fā)現(xiàn)，基于生物信息學(xué)分析顯示circRNA發(fā)揮著極其重要的生物學(xué)功...
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【circRNA】circRNA簡(jiǎn)介（1）cirRNA是非編碼RNA中的一大類，它由一種非經(jīng)典剪接方式——反向剪接(backsplicing)產(chǎn)生；當(dāng)反向剪接發(fā)生時(shí)，下游剪接位點(diǎn)與上游剪...
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