目前臨床醫(yī)學(xué)GWAS研究多基于此類The infinitesimal model（詳見：解釋復(fù)雜疾病的四種主流模型 CDCV/RAME/infi...
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基礎(chǔ)（一）GWAS和PRS的區(qū)別和聯(lián)系及其臨床應(yīng)用 -
GSE120974多組學(xué)分析復(fù)現(xiàn)0.數(shù)據(jù)介紹 這是一篇發(fā)表在Cancer Cell 2019 Sep的文章——Single-Cell Transcriptomics in Me...
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【R>>MOVICS】多組學(xué)+亞型秘密武器MOVICS包整合多組學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析，其安裝的過程太讓人心酸，大家安裝的過程慢慢體會(huì)，下面就來學(xué)習(xí)下這個(gè)由“大魚海棠”老師開發(fā)的R包吧。 1.示...
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重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS（二）：用GEMMA跑GWAS上一篇寫的是：重復(fù)一篇文獻(xiàn)的GWAS（一）：基因型數(shù)據(jù)整理這一篇主要講GWAS的核心流程和畫圖。 軟件使用參考：使用GEMMA進(jìn)行復(fù)雜性狀全基因...
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多組學(xué)文章思路解析2-蛋白組與外顯子組測(cè)序交互分析
多組學(xué)分析是指兩個(gè)及以上組學(xué)，同時(shí)做數(shù)據(jù)分析。通常是同一批樣本的多組學(xué)分析，常見有基因組、外顯子、轉(zhuǎn)錄組（含非編碼）、蛋白組、磷酸化組、代謝組等...
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多組學(xué)文章思路解析4-突變，轉(zhuǎn)錄，蛋白三組學(xué)聯(lián)合分析關(guān)于多組學(xué)數(shù)據(jù)挖掘分析， 我們之前討論了，蛋白組與糖基化組學(xué)分析，蛋白組與DNA突變的聯(lián)合分析，蛋白組與轉(zhuǎn)錄組的聯(lián)合分析。好像作者都會(huì)做蛋白組學(xué)...
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結(jié)直腸多組學(xué)文章解析 -20200909
?最近想必大家在公眾號(hào)上看到一則消息，幾乎刷屏。2020年9月3日，由中國科學(xué)院分子細(xì)胞科學(xué)卓越創(chuàng)新中心（生物化學(xué)與細(xì)胞生物學(xué)研究所）曾嶸研究組...
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蛋白組學(xué)文獻(xiàn)解析-20201014
?不知老師們是否發(fā)現(xiàn)，近一年來蛋白組學(xué)出現(xiàn)的頻率特別高，以往大家討論轉(zhuǎn)錄組基因組，今年基本都是蛋白組，由于前陣子幾篇CNS腫瘤大樣本蛋白組學(xué)的發(fā)...
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多組學(xué)文章思路解析3-蛋白組與轉(zhuǎn)錄組聯(lián)合分析討論
我們之前討論了蛋白組與糖基化組的聯(lián)合分析[http://www.itdecent.cn/p/ef52766aaa7a]文獻(xiàn)，蛋白組與外顯子的聯(lián)...
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典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - Limma差異分析、火山圖、功能富集
典型醫(yī)學(xué)設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)GEO數(shù)據(jù)分析 (step-by-step) - 數(shù)據(jù)獲取到標(biāo)準(zhǔn)化介紹了實(shí)驗(yàn)的設(shè)計(jì)、數(shù)據(jù)獲取、數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化和注釋，下面是如何利用L...
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