這個插件已經(jīng)下架了,上架了更好用的WGCNA shiny:http://www.itdecent.cn/p/4691c535a522[http...
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在做單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)分析的時候,獲得分群后我們希望知道每個群的marker基因是什么以此來描述細(xì)胞群的特征。其技術(shù)本質(zhì)就是利用某種規(guī)則獲得樣本(...
WGCNA分析教程,轉(zhuǎn)自生信技能樹分享WGCNA的實戰(zhàn)細(xì)節(jié): 一文看懂WGCNA 分析(2019更新版) 通過WGCNA作者的測試數(shù)據(jù)來學(xué)習(xí) 重...
前面由于對miRNA的探針數(shù)目沒有正確的理解,以為數(shù)據(jù)一直沒有下載完全,折騰了一番。后來經(jīng)老大jimmy提醒了,miRNA有2000左右的探針就...
前面已經(jīng)在老大jimmy的幫助下,知道我下載的表達(dá)矩陣是沒有問題的,那么我就直接往下做好了,不過在讀取id轉(zhuǎn)換的文件的時候,我又不會了!是因為我...
想要復(fù)現(xiàn)一篇WGCNA文章中的原圖,數(shù)據(jù)集時GSE85589,前面在下載數(shù)據(jù)時折騰了好久,原因是呢,我下載的矩陣的miRNA探針就只有2000來...
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè):下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面,做出作者文章中那樣的圖,但是分組很復(fù)雜,需要去...
Nov 21, 2019更新 => 修正部分function代碼,實現(xiàn)了導(dǎo)出gene2module 目的 最近有個項目又準(zhǔn)備跑WGCNA,...
I. Network analysis of liver expression data from female mice: finding m...
劉小澤寫于18.10.24最近開始寫第一篇英文小論文,練練手,為將來寫英文大論文做準(zhǔn)備 目錄 1 背景 Background Types of ...