寫在前面 伴隨著越來越多的全基因組序列公布，比較基因組分析已然常規(guī)生信數(shù)據(jù)分析技能。MCScan 是最為常用的軟件之一。久前，TBtools 已...
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插件 | 超快！全基因組共線性分析 -
『比較基因組學(xué)』TBtools 30秒解決基因組共線性。直接給我驚呆了，從點(diǎn)開開始到出結(jié)果一共32秒?_?，想當(dāng)年光blastp就得跑大半天，更不要說編譯MCScanX，各種奇葩問題... 先看下什么...
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「蛋白注釋」- 批量InterProScan注釋
Mar 20,2020 更新！ 什么是InterProScan數(shù)據(jù)庫 InterPro provides functional analysis...
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【跟著manual學(xué)軟件】MCScan-transposed軟件介紹 首先放官網(wǎng)：MCScanX-transposed: detecting transposed gene duplications ba...
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TBtools - 超過一萬人在使用的生信小工具寫在前面 TBtools 命令行接口一直保留著我開始開發(fā) TBtools 的時(shí)間。至今已有五年，也迭代了 至少150個(gè)的版本，累計(jì)不少于1000...
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基因家族分析4 || 多序列比對和進(jìn)化樹分析
基因家族流程：基因家族分析（一） 基因家族流程：基因家族分析（二） 基因家族流程：基因家族分析（三） =====================...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程(2)基因家族成員的基本分析包括基因成員的序列特征分析（分子量等電點(diǎn)等）基于motif分析成員序列保守特征與可視化（蛋白與核酸，可用于挖掘未知，尤其是核酸水平-非編碼水平的...
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構(gòu)建功能基因隱馬可夫模型HMM遇到的問題：fungene上的氮循環(huán)基因narG.hmm數(shù)據(jù)太老 http://fungene.cme.msu.edu/ 如圖共5條序列，一致的...
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基因家族分析 | 基因家族成員鑒定(hmm模型＆同源blast)方法一：基于hmm模型的鑒定方法 1.準(zhǔn)備數(shù)據(jù)①下載擬南芥基因組fasta文件、注釋文件gtf/gff3文件：ftp://ftp.ensembl...
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TBtools基因家族分析詳細(xì)教程（1）寫在前面：非常感謝CJ開發(fā)出如此強(qiáng)大的TBtools工具，作者詳細(xì)講解了基因家族的分析過程和意義，課程購買地址，講的很棒，可以試聽。 一共分為4...
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