Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等幾支主要的程序。主要用于轉(zhuǎn)錄組的組...
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Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等幾支主要的程序。主要用于轉(zhuǎn)錄組的組...
可變剪切定義 有些基因的一個mRNA前體通過不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點)產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體,這一過程稱為可變剪接(或選擇性剪接...
官網(wǎng):https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot 安裝:略 使用: py2.7使用 1.先給bam...
具體的介紹和使用方法及原理:使用rmats進(jìn)行可變剪切的分析(摘自生信修煉手冊) 原理:我理解的原理是他利用了3-4個外顯子,檢測哪個是exon...
可變剪切介紹: 什么是基因的可變剪切? 有些基因的前體mRNA(pre-mRNA)通過不同的剪接方式(選擇不同的剪接位點)產(chǎn)生不同的mRNA剪接...
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! MISO是一款經(jīng)典的可變剪切分析工具,和rmats類似,該軟件也支持對可變剪切事件進(jìn)行定量和差異分析,網(wǎng)址如下 ht...