Cufflinks下主要包含cufflinks,cuffmerge,cuffcompare和cuffdiff等幾支主要的程序。主要用于轉(zhuǎn)錄組的組...
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Cufflinks的使用詳解之--cuffdiff -
RNA-seq 可變剪切可變剪切定義 有些基因的一個mRNA前體通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點）產(chǎn)生不同的mRNA剪接異構(gòu)體，這一過程稱為可變剪接(或選擇性剪接...
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rmats2sashimiplot可變剪切可視化官網(wǎng)：https://github.com/Xinglab/rmats2sashimiplot 安裝：略 使用： py2.7使用 1.先給bam...
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rMATs的介紹及用法具體的介紹和使用方法及原理：使用rmats進(jìn)行可變剪切的分析（摘自生信修煉手冊） 原理：我理解的原理是他利用了3-4個外顯子，檢測哪個是exon...
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可變剪切軟件CASH測試
可變剪切介紹： 什么是基因的可變剪切？ 有些基因的前體mRNA（pre-mRNA）通過不同的剪接方式（選擇不同的剪接位點）產(chǎn)生不同的mRNA剪接...
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使用MISO進(jìn)行可變剪切的分析
歡迎關(guān)注”生信修煉手冊”! MISO是一款經(jīng)典的可變剪切分析工具，和rmats類似，該軟件也支持對可變剪切事件進(jìn)行定量和差異分析，網(wǎng)址如下 ht...
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