轉(zhuǎn)自“果子學(xué)生信” 一、首先獲取用于轉(zhuǎn)換的probe2symbol文件： 第１種方法 直接用平臺(tái)數(shù)據(jù)(網(wǎng)絡(luò)不好的可以直接略過(guò)) 轉(zhuǎn)換成數(shù)據(jù)框形...
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GEO芯片數(shù)據(jù)的探針I(yè)D轉(zhuǎn)換
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來(lái)自不同平臺(tái)GEO數(shù)據(jù)批次效應(yīng)除去批次效應(yīng)除去-GEO案例分析 最近分析來(lái)自不同平臺(tái)的GEO數(shù)據(jù)，GEO分析推薦學(xué)習(xí)Jimmy大神的B站視頻，也可以學(xué)習(xí)我之前的教程。limma和...
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bilibili-《GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘》筆記GEO數(shù)據(jù)挖掘看老大嗶哩嗶哩 看了三遍了，隨著理解，后續(xù)還要更新這篇記錄，現(xiàn)在還太不全，有些還沒(méi)跟上，代碼隨著理解要往上填... 0.GEO數(shù)據(jù)...
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學(xué)完老大GEO課程復(fù)現(xiàn)SCI文章差異基因的熱圖復(fù)現(xiàn)這篇文獻(xiàn)里的一幅熱圖 Tinagl1 Suppresses Triple-Negative Breast Cancer Progressio...
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非常詳細(xì)的GEO數(shù)據(jù)下載和清理，你要看嗎-GSE33532
來(lái)自數(shù)據(jù)集GSE33532,對(duì)于第一步獲得表達(dá)矩陣，做了還蠻詳盡的注解過(guò)程，希望能對(duì)其他人有幫助。雖然看上去全是黑色代碼快，但注解理解示例全在這...
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GEO數(shù)據(jù)挖掘用dat[ids$probe_id,] 取子集都是NA，該咋辦
GSE44077 數(shù)據(jù)集是GSE44077，pd信息經(jīng)過(guò)取冗余處理后得到了226行，11列的數(shù)據(jù)。 第一個(gè)疑問(wèn)，如何從pd$characteri...
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