當基因組某些區(qū)域可能有著比較高的雜合度，這會導致基因組該區(qū)域的兩個單倍型被分別組裝成primary contig， 而不是一個為primary ...
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利用purge_haplotigs去雜合 -
生信 | 基因組組裝實戰(zhàn)（三）：Kmer評估基因組寫在前面 以下內容均來自我在菲沙基因（Frasergen[http://www.frasergen.com/]）暑期生信培訓班上記錄的課堂筆記 ...
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「生信」共線性分析——MCScanX目錄MCScanX下載及安裝數據準備MCScanX運行及結果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便...
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paml計算dn/ds的小實例更新：20190319 使用EasyCodeML完成dnds的計算，自己嘗試了分支模型和位點模型的計算，簡直不要太容易！ 更新：20190314...
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同源注釋工具GeneWise安裝和使用
這是一個非常老的軟件，距離他不更新至少有10多年了，但是目前還是有很多公司用他進行基因組注釋，包括ENSEMBL的注釋流程的幾個核心部分用到的也...
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使用NextDenovo組裝Nanopore數據
NextDenovo是武漢未來組胡江博士團隊開發(fā)的一個三代組裝工具，能夠用于PacBio和Nanopore數據的組裝。但是從官方的介紹而言，此工...
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矯正基因結構注釋 - 做有良心的基因家族分析寫在前面 半個月前，我推了一個《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實是開給課題組）。在熱身課程（完全免費）中，將我個人對基因家族分...
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