Introduction 分享一些R進(jìn)階使用的技巧，相當(dāng)于是之前寫(xiě)的R語(yǔ)言學(xué)習(xí)[../r-learning]的實(shí)踐和總結(jié)了。 Online sl...
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R進(jìn)階使用技巧 -
R調(diào)用Taxonkit展示系統(tǒng)發(fā)育信息Introduction TaxonKit[https://bioinf.shenwei.me/taxonkit/chinese/]是一個(gè)用于處...
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R繪制優(yōu)美的進(jìn)化樹(shù)（進(jìn)階）上次已經(jīng)介紹過(guò)了使用R繪制系統(tǒng)發(fā)育樹(shù)的基本用法[http://www.itdecent.cn/p/b6c4d3376bc9]，也埋下一個(gè)小坑：...
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開(kāi)發(fā)一個(gè)Rshiny應(yīng)用（基礎(chǔ)）Introduction Shiny 是一個(gè) R 包，可輕松地直接從 R 構(gòu)建交互式 Web 應(yīng)用程序。還可以在網(wǎng)頁(yè)上托管獨(dú)立應(yīng)用程序或?qū)⑺鼈兦?..
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R統(tǒng)計(jì)分析Introduction 統(tǒng)計(jì)分析在生物信息學(xué)中具有非常重要的意義，因?yàn)樯镄畔W(xué)研究的數(shù)據(jù)量龐大、復(fù)雜性高，而統(tǒng)計(jì)分析可以幫助我們更好地理解和...
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微生物群落構(gòu)建（community assembly）Introduction 了解控制群落多樣性、功能、演替和生物地理學(xué)的機(jī)制是生態(tài)學(xué)，尤其是微生物生態(tài)學(xué)中的一個(gè)核心。推薦閱讀綜述： Zhou, ...
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ReporterScore包(GRSA方法)正式發(fā)表于雜志Briefings in Bioinformatics最近，我開(kāi)發(fā)的R包ReporterScore（GRSA方法）發(fā)表在Briefings in Bioinformatics上了，這是一種靈活的，可...
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降維/排序分析（ordination analysis）Introduction ordination analysis（排序分析）是生態(tài)學(xué)和統(tǒng)計(jì)學(xué)領(lǐng)域中用于分析和解釋多變量數(shù)據(jù)的方法之一。這個(gè)方法通...
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ReporterScore 包的一些更新最近ReporterScore 包又新加了一些好用的功能，比如完善通路數(shù)據(jù)庫(kù)，包括pathway-ko，pathway-gene，pathway...
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使用ReporterScore包進(jìn)行富集分析Introduction 上次已經(jīng)在一篇推文[https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzkwMjQxODQ5MA==...
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