一. 示例數(shù)據(jù)準(zhǔn)備 下載：鏈接：https://pan.baidu.com/s/1_b8swSkWDqIHZi6UwKaspA提取碼：pll7 ...
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R 數(shù)據(jù)可視化 01 | 聚類(lèi)熱圖 -
enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實(shí)現(xiàn)了幾種可視化方法來(lái)幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
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UCSCXenaShiny實(shí)現(xiàn)基因表達(dá)的Pancer(泛癌）展示UCSCXenaShiny包由我和幾位小伙伴共同開(kāi)發(fā)，如果對(duì)您有幫助請(qǐng)致謝我們，并引用我們的R包，有什么問(wèn)題也可以給我們反饋。網(wǎng)址為https:...
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從GEO數(shù)據(jù)下載到limma差異分析，再到topGO富集分析一個(gè)失敗案例，不要點(diǎn)進(jìn)來(lái) GSE2034 topGO 1. DEG 1.1 下載GEO數(shù)據(jù) 1.2 表達(dá)矩陣 before: after: 1....
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R語(yǔ)言GEO數(shù)據(jù)挖掘01-數(shù)據(jù)下載及提取表達(dá)矩陣
作者：白介素2 這一節(jié)的內(nèi)容包括應(yīng)用 GEOquery包下載芯片數(shù)據(jù)，提取表達(dá)矩陣，提取metadata信息。解決一個(gè)探針對(duì)應(yīng)多個(gè)基因的問(wèn)題 G...
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R實(shí)戰(zhàn) | TCGA數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)--BRCA篇本文寫(xiě)于觀看生信技能樹(shù)公眾號(hào)（vx: biotrainee）的七步走純R代碼通過(guò)數(shù)據(jù)挖掘復(fù)現(xiàn)一篇實(shí)驗(yàn)文章（第1到6步）[https://mp.w...
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R實(shí)戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-5
本文將介紹RNA-seq基因富集分析的實(shí)戰(zhàn)代碼。原文地址：https://bioinformatics-core-shared-training...
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R實(shí)戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-4Annotation and Visualisation of RNA-seq results 本文將介紹RNA-seq差異分析結(jié)果可視化的實(shí)戰(zhàn)...
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R實(shí)戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-3Differential Expression of RNA-seq data 本文將要介紹的是在R中進(jìn)行RNA-seq 數(shù)據(jù)基因表達(dá)差異分析的...
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R實(shí)戰(zhàn) | 用R也可以完成的RNA-Seq分析-2Pre-processing 本文將要介紹的是在R中進(jìn)行RNA-seq 數(shù)據(jù)預(yù)處理的實(shí)戰(zhàn)代碼原文地址：https://bioinformatic...
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