這一推送將簡單介紹： 1.尋找蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)域 2.簡單預(yù)測序列的理化性質(zhì) 4. 預(yù)測蛋白酶降解位點 5.預(yù)測卷曲螺旋區(qū)域（coiled-coil ...
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【陪你學(xué)·生信】六、當(dāng)你有一段待分析的氨基酸序列
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生物數(shù)據(jù)庫
生物數(shù)據(jù)庫 基本序列格式 1.FASTA格式：首行為描述行，以>為起始，其后為描述信息；第二行即為原始序列。2.FASTQ格式:FASTQ格式包...
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植物啟動子-順式作用元件-批量提取-預(yù)測-可視化分析寫在前面 以前總看到問題是，基因結(jié)構(gòu)可視化的問題；現(xiàn)在則變成了啟動子元件的預(yù)測或者說可視化。這本身比較簡單，也比較玄乎，所以我一直不是太樂意與別...
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TBtools | 多圖合一至強版教程！進(jìn)化樹 + Motifs + 結(jié)構(gòu)域 + 啟動子 + 基因結(jié)構(gòu) + ....放一張效果圖，這些，三四年前的東西，我其實一直懶得說。 寫在前面 “Gene Structure View (Advanced)”這個功能可以說...
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使用HMM進(jìn)行基因家族鑒定？無人不能。寫在前面 很久很久以前，各種原因，我寫過一個帖子，《零基礎(chǔ)-完全重現(xiàn)某個基因家族分析文章（的分析部分）》 https://www.jianshu...
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IQ-TREE的使用 - 超快速用極大似然法構(gòu)建進(jìn)化樹
寫在前面 我知道IQ-tree已經(jīng)有很長一段時間了。不過我一直并沒有使用它。主要原因是，常用的快速構(gòu)建ML樹的軟件是FastTree，如果要求準(zhǔn)...
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矯正基因結(jié)構(gòu)注釋 - 做有良心的基因家族分析寫在前面 半個月前，我推了一個《任何人都能掌握-基因家族分析》的騰訊課程（原本事實是開給課題組）。在熱身課程（完全免費）中，將我個人對基因家族分...
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「IGV-GSAme」基因結(jié)構(gòu)注釋信息-人工矯正-神器IGV-Gene Structure Annotation Manual Editor，簡稱IGV-GSAme 寫在前面 igv是目前最常用的本...
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TBtools | 快速（以分鐘計）且準(zhǔn)確地獲取家族進(jìn)化分支成員寫在前面 生物信息數(shù)據(jù)下游分析，是一個非常復(fù)雜，且?guī)缀鯖]有也不可能流程化的操作。究其原因，但凡貼近生物學(xué)問題，需要更多生物學(xué)視角，甚至是研究人員...
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零基礎(chǔ)-絕對完成GO/KEGG pathway富集分析-和-繪圖寫在前面 約莫一個月前，不知為何，突然收到好幾個朋友問了一些TBtools的使用問題。按照我個人的設(shè)想，TBtools的使用應(yīng)該不會存在使用問題...
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