在我們涉足單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析不久之后就會發(fā)現(xiàn)，我們在和一套新的理念打交道。在這套理念中，對象是常見的，數(shù)據(jù)是多維的，往往是一張核心表及其附屬。我們對...
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為什么要以數(shù)據(jù)庫的思維來理解單細(xì)胞數(shù)據(jù) -
「文獻(xiàn)03」從lncRNA的角度進(jìn)一步挖掘發(fā)表過的單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù)結(jié)合單細(xì)胞測序和功能篩選揭示lncRNA H19對胚胎造血干細(xì)胞發(fā)育的關(guān)鍵作用 日期：2019年1月19日——2019-Week3分類：「思路」...
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必備轉(zhuǎn)錄組表達(dá)分析知識圖譜
說明：因為平臺限制和平臺廣告等原因，今后的文章將不在簡書更新，請移步并訂閱個人博客說明：因為平臺限制和平臺廣告等原因，今后的文章將不在簡書更新，...
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Day2-單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組分析綜述劉小澤寫于19.4.1中午寫到晚上，總共10個小時研究一篇綜述，收獲滿滿，還是看綜述最給力，帶領(lǐng)我們快速了解一個領(lǐng)域 這篇關(guān)于單細(xì)胞的綜述發(fā)表于...
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pheatmap熱圖技巧合集突然間發(fā)現(xiàn)，我一做熱圖就用pheatmap幾乎不存在第二個選項了。是時候跑一遍pheatmap的demo了. Examples scale是一個...
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系統(tǒng)學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序scRNA-Seq(四)劉小澤寫于19.3.26陌生的領(lǐng)域就像一張白紙，怎么畫就看自己了 前言 關(guān)于單細(xì)胞測序，我們已經(jīng)知道了它和bulk RNA-seq的區(qū)別，簡單說...
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conda的安裝與使用 2.0版（2022-08-12更新）有很多的生信軟件都可以通過conda安裝，省去了很多的安裝、修bug的煩惱。經(jīng)常是安裝到崩潰的軟件，conda一行命令就搞定了。前兩天有個胖友問...
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系統(tǒng)學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序scRNA-Seq(二)劉小澤寫于19.3.16看了一篇綜述，又加了一些擴(kuò)展知識 文章 這是一篇2017發(fā)表在Genome Medicine上的文章A practica...
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系統(tǒng)學(xué)習(xí)單細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組測序scRNA-Seq(一)劉小澤寫于19.3.15好了，終于可以學(xué)新知識了【預(yù)計將是一項大工程】，單細(xì)胞測序是目前研究的熱點，那么我重新回來探究一下，首先問自己幾個問題 ...
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第36周-時間序列表達(dá)矩陣揭示腫瘤轉(zhuǎn)移的動態(tài)過程
時間序列表達(dá)矩陣揭示腫瘤轉(zhuǎn)移的動態(tài)過程 肝癌很可怕，尤其是轉(zhuǎn)移后，很多關(guān)于其轉(zhuǎn)移前后對比的研究，但是缺乏中間過程數(shù)據(jù)，特別是轉(zhuǎn)移臨界點。 作者通...
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