有人說(shuō)Y叔的clusterpofiler的GO注釋結(jié)果和其他工具不一樣，后來(lái)詢問(wèn)，發(fā)現(xiàn)分析物種是擬南芥。這就讓我想起了我之前的一篇文章，「Bio...
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「Bioconductor」再次提醒，研究植物的不要輕易相信你用的注釋包 -
TAIR周期性更新的注釋原來(lái)不在FTP服務(wù)器上更新的數(shù)據(jù)怎么用？看下面兩篇 http://www.itdecent.cn/p/8963f396bfed https://www.jiansh...
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「Bioconductor」不要輕易相信AnnotationHub的物種注釋包
Bioconductor開(kāi)發(fā)的物種注釋包系列集合了一個(gè)物種不同來(lái)源的注釋信息，能夠根據(jù)基因ID對(duì)其進(jìn)行多種來(lái)源的注釋，比如說(shuō)基因的別名，基因的功...
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用SOM畫(huà)一個(gè)我認(rèn)為還行的圖
用SOM package畫(huà)一個(gè)還行（我認(rèn)為）的圖 SOM package 和kohonen package都可以做SOM cluster分析。k...
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SOM基因表達(dá)聚類分析初探
上周的暑期生信黑馬培訓(xùn)有老師提出要做SOM分析，最后卡在code plot只能出segment plot卻出不來(lái)line plot。查了下，沒(méi)看...
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（轉(zhuǎn)帖）-WGCNA（常用）
原文地址：https://mp.weixin.qq.com/s/3K7vQVOHZkUvYGI8XYUwiA 今天推薦給大家...
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WGCNA分析，簡(jiǎn)單全面的最新教程本文應(yīng)該是第二全的WGCNA分析教程，參考了最新的文檔。第一全的還在路上，會(huì)出現(xiàn)于生信寶典和宏基因組公眾號(hào)組織的二代三代轉(zhuǎn)錄組測(cè)序分析實(shí)戰(zhàn)班上，...
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