看到了jimmy老師的下述文章,才發(fā)現(xiàn)之前寫的RNAseq實(shí)戰(zhàn)還漏了個轉(zhuǎn)錄因子富集分析:常規(guī)轉(zhuǎn)錄差異建議都加上一個轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù) (qq.com)...
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看到了jimmy老師的下述文章,才發(fā)現(xiàn)之前寫的RNAseq實(shí)戰(zhàn)還漏了個轉(zhuǎn)錄因子富集分析:常規(guī)轉(zhuǎn)錄差異建議都加上一個轉(zhuǎn)錄因子數(shù)據(jù) (qq.com)...
本節(jié)概覽:1. Cytoscape 軟件基本介紹2. 數(shù)據(jù)導(dǎo)入:蛋白互作節(jié)點(diǎn)信息導(dǎo)入、其他注釋信息的導(dǎo)入3. PPI網(wǎng)絡(luò)圖繪制:?選取部分節(jié)點(diǎn)展...
最近在看差異分析當(dāng)中原始read counts是如何被校正的,自然就不會放過差異分析的經(jīng)典之一 —— edgeR. edgeR使用的校正方法稱為...
基于轉(zhuǎn)錄組測序獲得的定量表達(dá)值,識別差異表達(dá)變化的基因或其它非編碼RNA分子,實(shí)際上方法還是非常多的。但就目前來看,DESeq2和edgeR是出...
本體是給定域內(nèi)的知識體系的正式表示。本體通常由一組具有在它們之間運(yùn)行的關(guān)系的類(或術(shù)語或概念)組成。基因本體論(GO)從三個方面描述了我們對生物...
首先,基因本體論(Gene Ontology)和基因文庫不是同一概念。 我從下面幾個方面講一下GO的一些概 念和基本方法(感謝劉老師提供的資料)...
一、什么是生物學(xué)功能 根據(jù)Paul D. Thomas的說法,現(xiàn)在關(guān)于什么是生物學(xué)功能的討論主要有兩種:"causal role functio...
1、p-value 單個假設(shè)檢驗(yàn)中主要依靠p值(或統(tǒng)計(jì)量t)做出是否拒絕零假設(shè)H0的決定:p-value和預(yù)先設(shè)定的檢驗(yàn)水準(zhǔn) α 做對比,如果p...
(109條消息) p-value,p-adjust,q-value三者的定義與使用_小C_先生的博客-CSDN博客_adjust p value...
本教程問題:1.mmGO.rdata文件的制作,是否不需要這一步,更改一下腳本即可實(shí)現(xiàn)呢?2.這樣的圖形美化,目前的圖還不是很滿意,需要進(jìn)行美化...