前言 我是在y蜀黍的書里(搜索clusterProfiler book 即可找到)看到了一個叫msigdbr的包，就是把MsigDB的那些基因集...
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GSEA和GSVA，再也不用去下載gmt文件咯 -
基于R對TCGA患者臨床數(shù)據(jù)整理和Cox分析
一、數(shù)據(jù)整理 1 導(dǎo)入數(shù)據(jù) 利用data.table包導(dǎo)入數(shù)據(jù)，以LUAD為例 2 選擇感興趣的臨床信息 一般常規(guī)項包括submitter_id...
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R包c(diǎn)lusterProfiler: 轉(zhuǎn)換ID、GO/KEGG富集分析參考這篇ID轉(zhuǎn)換不用怕，clusterProfiler幫你忙這篇詳細(xì)講了無參考基因組該怎么辦，值得一看 簡單介紹一下幾種常用的ID：Ensemb...
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R語言：clusterProfiler進(jìn)行GO富集分析和Gene_ID轉(zhuǎn)換
一、讀取文件，ID轉(zhuǎn)換 1.讀取文件 2.ID轉(zhuǎn)換，ENTREZID是進(jìn)行GO分析最好的ID類型（針對clusterProfiler） ID轉(zhuǎn)換...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1943508/1615129612.jpg', '推薦專題《生信》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/4adeede37aed?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認(rèn)gb2312'));){kind=link}