●可變剪切(differential splicing)也叫做選擇性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前體到成熟m...
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●可變剪切(differential splicing)也叫做選擇性剪切alternative splicing, 指的是在mRNA前體到成熟m...
counts矩陣的構(gòu)建 FPKM/RPKM (Fragments/Reads Per Kilobase Million ) 每千個(gè)堿基的轉(zhuǎn)錄每...
Spearman相關(guān)性分析 使用TPM值 PCA 使用TPM值
1 建索引 2 比對(duì)(若用于GATK,可不排序輸出sam文件) 1)常規(guī)比對(duì)(一次2個(gè)吧, 用于差異分析) 2-pass模式(用于RNA數(shù)據(jù)的G...
GO分析(上下調(diào)基因分開(kāi)做,可用于BP,CC,MF分開(kāi)畫(huà)圖) GO分析(上下調(diào)一起做,強(qiáng)烈推薦,可以看整體結(jié)果,并可選取其中的部分畫(huà)圖) GO ...
DESeq2進(jìn)行差異分析 1 ###數(shù)據(jù)讀入和處理 2 #### dds矩陣的創(chuàng)建 #### 3 ### DESeq2進(jìn)行差異分析 #####...
1 ###文件下載 2 ## 循環(huán)把下載的所有sra文件都變?yōu)閒astq(雙端測(cè)序數(shù)據(jù)) 3 ### fastp質(zhì)量控制 4 ###參考基因組下...