主要參考生信技能樹RNA-seq基礎(chǔ)入門 http://www.biotrainee.com/thread-1750-1-1.html 1. 系...
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RNAseq001 轉(zhuǎn)錄組入門(1) ：資源準(zhǔn)備 -
RNAseq002 轉(zhuǎn)錄組入門(2) ：數(shù)據(jù)下載1 獲取文章數(shù)據(jù) 1.1 獲得文章數(shù)據(jù)地址 AKAP95 regulates splicing through scaffolding RNAs...
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RNAseq003 轉(zhuǎn)錄組入門(3)：了解fastq測(cè)序數(shù)據(jù)1 基礎(chǔ)了解 NGS008 測(cè)序常用名詞NGS009 生信常用數(shù)據(jù)格式NGS010 測(cè)序數(shù)據(jù)質(zhì)控 2 fasta與fastq 一般NGS測(cè)序數(shù)據(jù)...
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RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)：參考基因組下載1 參考基因組 以下內(nèi)容主要參考jimmy大佬的生信技能樹及生信菜鳥團(tuán)公眾號(hào) 1.1 【直播】我的基因組（五）:測(cè)試數(shù)據(jù)及參考基因組的準(zhǔn)備 這個(gè)...
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RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)1 比對(duì)的目的 1.1 差異表達(dá)基因只需要確定不同的read計(jì)數(shù)，可以用bowtie, bwa這類比對(duì)工具，或者是salmon這類align-f...
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RNAseq006 轉(zhuǎn)錄組入門(6)：reads計(jì)數(shù)傳送門： RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)：參考基因組下載RNAseq003 轉(zhuǎn)錄組入門(3)...
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RNAseq007 轉(zhuǎn)錄組入門上游分析全流程
傳送門： RNAseq006 轉(zhuǎn)錄組入門(6)：reads計(jì)數(shù)RNAseq005 轉(zhuǎn)錄組入門(5)：序列比對(duì)RNAseq004 轉(zhuǎn)錄組入門(4)...
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NGS012 轉(zhuǎn)座酶建庫(kù)及ATAC-seq轉(zhuǎn)座因子 Transposon 一段DNA順序可以從原位上單獨(dú)復(fù)制或斷裂下來，環(huán)化后插入另一位點(diǎn)，并對(duì)其后的基因起調(diào)控作用，此過程稱轉(zhuǎn)座。這段序...
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