這篇文章很長，超過1萬字，是本系列中最重要的一篇，因為我并非只是在簡單地告訴大家?guī)讞l硬邦邦的操作命令。對于新手而言不建議碎片時間閱讀，對于有一定...
投稿
收錄了6篇文章 · 131人關(guān)注
-
從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第4節(jié) 構(gòu)建WGS主流程 -
從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第2節(jié) FASTA和FASTQ在WGS數(shù)據(jù)的分析過程中，我們會接觸到許多生物信息學/基因組學領(lǐng)域所特有的數(shù)據(jù)文件和它們特殊的格式，在這一節(jié)中將要介紹的FASTA和FASTQ便...
-
從零開始完整學習全基因組測序（WGS）數(shù)據(jù)分析：第1節(jié) DNA測序技術(shù)前言 基因測序已是時下熱門，目前除了華大基因之外，其他分布于全中國的大型測序平臺（HiSeq X 10）還有約10個，每個每年大概能完成1.8萬...
-
生信筆記收藏匯總
更新日期：2018/3/13 這里匯總一些生信分析和數(shù)據(jù)可視化相關(guān)的推文或筆記，為知筆記里存的東西太雜太亂，花了一天的時間初步整理了下。點擊跳轉(zhuǎn)...
-
RNAseq 必讀綜述和在線教程最近讀到一篇博文，介紹了學習 RNAseq 數(shù)據(jù)分析非常推薦的兩篇綜述和七個在線教程并發(fā)表了相關(guān)評論。本文將進行簡要整理并對相關(guān)評論內(nèi)容進行大致...
-
測序數(shù)據(jù)基本信息統(tǒng)計 | reads,coverage,depth
00 寫在前面 測序后公司交付數(shù)據(jù)時，一般會提供質(zhì)控后的clean data和后續(xù)的基礎分析結(jié)果。因為可能需要自己來進行數(shù)據(jù)的預處理，記得一定要...
-
RNA-seq分析的流程及軟件前言：觀看B站孟浩巍的系列視頻2017-08-04-高通量測序技術(shù)交流錄像，內(nèi)容頗多，直接記錄筆記代碼，沒有經(jīng)過本地運行，僅作記錄，他日再做梳理...
-
GATK4.0和全基因組數(shù)據(jù)分析實踐（上）前言 在前面的一系列WGS文章中，我講述了很多基因數(shù)據(jù)分析的來龍去脈，雖然許多同學覺得很有幫助，但是卻缺了一個重要的環(huán)節(jié)——沒有提供實際可用的數(shù)...
-
GATK4全基因組數(shù)據(jù)分析最佳實踐,我以這篇文章為標志,終結(jié)當前WGS系列數(shù)據(jù)分析的流程主體問題 | 完全代碼這是我根據(jù)之前的WGS系列和GATK4實踐文章進行重新梳理之后確定下來的分析流程，這是一個WGS的最佳實踐，它基于GATK4和我的實際經(jīng)驗，稍作...
-
在線RNA-seq可視化網(wǎng)站-目前見過最流弊的（多圖慎點）先丟鏈接http://bioinformatics.sdstate.edu/idep/ 能做什么？可視化見過最全的的在線RNA-seq分析，把這...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1662546/crop1536704890664.jpg', '推薦專題《NGS分析流程》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/5dfe3942f2f0?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}