本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站” https://mp.weixin.qq.com/s/k7yzk9hPX3Bi-ohAo83ZYw還有其他 R統(tǒng)計(jì) ...
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生存分析作為分析疾病/癌癥預(yù)后的出鏡頻率超高的分析手段,而其結(jié)果展示的KM曲線也必須擁有姓名和顏值! 生存分析相關(guān)推文: 生存分析和KM曲線:R...
多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹(shù) 前面我在生信技能樹(shù)推文:你確定你的差異基因找對(duì)了嗎? 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個(gè)樣品并沒(méi)有按照...
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè):下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面,做出作者文章中那樣的圖,但是分組很復(fù)雜,需要去...
因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀,所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析,挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合,或...
https://github.com/ChristiaenLab/ATAC-seq對(duì)應(yīng)文章連接
Comparing ELMER TCGA-BRCA and ATAC-seq inference linkages of loci (DNA m...
以下是B站生信技能樹(shù)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的: 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù):了解數(shù)據(jù)存放位置; 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式; 介紹...
今天我們介紹一篇稍高分?jǐn)?shù)的文章,來(lái)看一下生信挖掘文章如何發(fā)更高檔次的雜志。這篇文章是利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘?qū)m頸癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因,201...
本文首發(fā)于公眾號(hào)“生信補(bǔ)給站”,https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介紹了使...