本文首發(fā)于“生信補(bǔ)給站” https://mp.weixin.qq.com/s/k7yzk9hPX3Bi-ohAo83ZYw還有其他 R統(tǒng)計(jì) ...
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deconstructSigs|探尋cosmic的獨(dú)特“氣質(zhì)”-mutation signature ！
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R|生存分析 - KM曲線 ，值得擁有姓名和顏值
生存分析作為分析疾病/癌癥預(yù)后的出鏡頻率超高的分析手段，而其結(jié)果展示的KM曲線也必須擁有姓名和顏值！ 生存分析相關(guān)推文： 生存分析和KM曲線：R...
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多種批次效應(yīng)去除的方法比較-轉(zhuǎn)自生信技能樹(shù)
多種批次效應(yīng)去除的方法比較 原創(chuàng) 生信技能樹(shù) 前面我在生信技能樹(shù)推文：你確定你的差異基因找對(duì)了嗎？ 提出了文章的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)的60個(gè)樣品并沒(méi)有按照...
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折騰了許久才復(fù)現(xiàn)出的WGCNA圖-GSE106292你值得擁有
前些天老大布置了WGCNA的作業(yè)：下載GSE106292 數(shù)據(jù)集的 Excel表格如何讀入R里面，做出作者文章中那樣的圖，但是分組很復(fù)雜，需要去...
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STEP6:WGCNA相關(guān)性分析因?yàn)闃颖緮?shù)量比較可觀，所以可以進(jìn)行WGCNA分析。這里是并不需要選取所有的基因來(lái)做WGCNA分析，挑選的標(biāo)準(zhǔn)可以是top變異程度大的基因集合，或...
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[2] CNS 腳本收集 ATAC-seqhttps://github.com/ChristiaenLab/ATAC-seq對(duì)應(yīng)文章連接
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[1] Science 腳本收集Comparing ELMER TCGA-BRCA and ATAC-seq inference linkages of loci (DNA m...
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GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘—生信技能樹(shù)B站視頻以下是B站生信技能樹(shù)GEO數(shù)據(jù)庫(kù)挖掘的課程筆記 主要內(nèi)容及學(xué)習(xí)目的： 介紹GEO數(shù)據(jù)庫(kù)：了解數(shù)據(jù)存放位置； 介紹GSE項(xiàng)目的3種下載方式； 介紹...
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GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘生物信息文章解讀（宮頸癌） TCGA GEO
今天我們介紹一篇稍高分?jǐn)?shù)的文章，來(lái)看一下生信挖掘文章如何發(fā)更高檔次的雜志。這篇文章是利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)挖掘?qū)m頸癌預(yù)后相關(guān)的關(guān)鍵基因，201...
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maftools|TCGA腫瘤突變數(shù)據(jù)的匯總，分析和可視化
本文首發(fā)于公眾號(hào)“生信補(bǔ)給站”，https://mp.weixin.qq.com/s/WG4JHs9RSm5IEJiiGEzDkg 之前介紹了使...
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