教程對(duì)應(yīng)B站：【生信技能樹】轉(zhuǎn)錄組測(cè)序數(shù)據(jù)分析鏈接：https://www.bilibili.com/video/av28453557?from...
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RNA-seq小考核 -
通過整理TCGA數(shù)據(jù)，探索某癌癥的癌組織和正常組織的差異基因。
實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì) 實(shí)驗(yàn)?zāi)康臎Q定試驗(yàn)方法和途徑。試驗(yàn)?zāi)康?:獲取三陰性乳腺癌的正常組織和癌癥組織的基因表達(dá)差異情況，比較三陰性乳腺癌中的基因表達(dá)變化情況。...
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學(xué)習(xí)生物信息，我都應(yīng)該掌握那些內(nèi)容？持續(xù)更新ing.....最后更新時(shí)間：2019/3/8 10:28 AM 1.linux命令 1.1 linux的權(quán)限 權(quán)限： eg： 7=4...
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RNA-seq分析簡潔版前面RNA-seq分析：從軟件安裝到富集分析部分已經(jīng)把轉(zhuǎn)錄組全部流程走完了一遍，這次利用RNA-seq(2)-2:下載數(shù)據(jù)中下載的肝癌數(shù)據(jù)進(jìn)行分...
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RNA-seq(10):KEGG通路可視化:gage和pathview這部分直接從上部分RNA-seq(9):富集分析(功能注釋)[http://www.itdecent.cn/p/5d82acad6008]的數(shù)...
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RNA-seq分析：從軟件安裝到富集分析詳細(xì)過程
RNA-seq分析簡潔版[http://www.itdecent.cn/p/72c871663e62],用重新下載的肝癌數(shù)據(jù)[https://...
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RNA-seq(9):功能富集分析這部分開始進(jìn)行基本的富集分析，兩類 A：差異基因富集分析（不需要表達(dá)值，只需要gene name） B: 基因集(gene set)富集分析（不...
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RNA-seq(8): 探索分析結(jié)果:Data visulization寫在前面： 這部分主要做一些數(shù)據(jù)可視化，富集分析暫時(shí)放下一部分，如果想跳過這里，請(qǐng)直接移步RNA-seq(9):富集分析[https://www...
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RNA-seq(7): DEseq2篩選差異表達(dá)基因并注釋(bioMart)============================================寫在前面：可以參考另外一篇《得到差異基因后怎么做？[ht...
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RNA-seq(6): reads計(jì)數(shù)，合并矩陣并進(jìn)行注釋任務(wù) 1.實(shí)現(xiàn)這個(gè)功能的軟件也很多，還是煩請(qǐng)大家先自己搜索幾個(gè)教程，入門請(qǐng)統(tǒng)一用htseq-count，對(duì)每個(gè)樣本都會(huì)輸出一個(gè)表達(dá)量文件。2.需...
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