在實(shí)驗(yàn)室經(jīng)常聽(tīng)到師兄師姐評(píng)估基因組提到一個(gè)點(diǎn)就是，基因組能拼成圈嗎，當(dāng)時(shí)還是生信小白（現(xiàn)在是個(gè)資深小白）的我僅僅見(jiàn)識(shí)過(guò)circos的華麗圖片，以...
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生信log21|基因組成圈了嗎？-拼接路徑可視化軟件Bandage結(jié)果詳解 -
生信log19|原核基因組分析part2-本地個(gè)性化分析（序列建庫(kù)部分真核也適用）??這篇寫(xiě)得太久了，還有很多不滿意的地方，決定先放出來(lái)再慢慢完善。剛來(lái)實(shí)驗(yàn)室的那會(huì)兒，經(jīng)常聽(tīng)到實(shí)驗(yàn)室的師兄說(shuō)建庫(kù)，pfam,antismash諸如...
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生信log18|一個(gè)上傳基因組到NCBI的圖文詳細(xì)教程開(kāi)篇廢話一下：> 這篇日志分享的實(shí)際上是我總結(jié)了NCBI基因組上傳流程并分享給組內(nèi)同學(xué)參考的PPT教程，當(dāng)然我們PPT上面還有16S rRNA基...
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生信log12|"Dataset"-NCBI批量下載基因組數(shù)據(jù)新工具嘗鮮&測(cè)評(píng)｜MacOS寫(xiě)在前言，雖然筆主真的很喜歡幾行命令行就能解決很多重復(fù)勞動(dòng)，但本人還是被傻瓜式軟件吃得死死的，哎真香。在此介紹一下 NCBI官網(wǎng)自己新出的一個(gè)批...
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生信log4|Biostar生信學(xué)習(xí)小記(MacOS平臺(tái))|zcat的作妖&解決辦法
所以理論跟實(shí)踐又是另外一回事了!!!! MacOS 上運(yùn)行zcat結(jié)果出現(xiàn)了zcat: can't stat: prot.accession2t...
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生信log5|Biostar|global/local-align.sh腳本的一點(diǎn)點(diǎn)更新腳本的出錯(cuò) 打開(kāi)一比對(duì)結(jié)果發(fā)現(xiàn)報(bào)錯(cuò)了！說(shuō)是第四十一行多了個(gè)括號(hào) 打開(kāi)看一下41行長(zhǎng)什么樣子Screenshot 2020-08-11 at 11...
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生信log9|(MacOS)記core-pan泛基因計(jì)算工具Roary安裝的一個(gè)大坑(Perl)&&解決辦法前言背景前段時(shí)間重裝系統(tǒng)Anaconda全沒(méi)了，重裝了之后就沒(méi)咋管過(guò)，直到最近要用到Roary，conda config中只有defaults這...
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生信log10|網(wǎng)頁(yè)版｜RobeTTaFold-蛋白質(zhì)預(yù)測(cè)嘗鮮記錄最近AlphaFold2開(kāi)源了，然后另一個(gè)靈感來(lái)自AlphaFold的RobeTTaFold[https://robetta.bakerlab....
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生信log3|Biostar生信學(xué)習(xí)小記|Taxonkit踩坑記錄報(bào)錯(cuò)&解決(MacOS平臺(tái)）平臺(tái)：MacOS，系統(tǒng):Catalina 初次使用剛裝上開(kāi)箱后就用 結(jié)果出現(xiàn)了上圖的報(bào)錯(cuò)，查找了官網(wǎng)發(fā)現(xiàn)，原來(lái)還需提前額外再裝一個(gè)taxdump...
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markdown語(yǔ)法｜emoji用代碼敲表情包
感覺(jué)啥都能用代碼敲就很棒啊，期待明年此時(shí)在文本上面的編輯已經(jīng)完全脫離鼠標(biāo)，此篇記錄一下代碼編輯筆記的日常 語(yǔ)法規(guī)則 github, Typora...
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