在實(shí)踐之前，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識(shí)點(diǎn)：（參考文章：http://www.itdecent.cn/p/8aca72809c5c） 組...
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ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析) -
m6A-lncRNA week01
title: "m6A-LGG-week1"author: "Hannisal"date: "2020/10/3" 1.TCGA的數(shù)據(jù)下載 用T...
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R獲取芯片平臺(tái)與注釋【檢索】
劉小澤寫于18.9.12處理芯片數(shù)據(jù)離不開注釋包，并且不同的芯片數(shù)據(jù)使用不同的注釋。知道GSE號(hào)后就能知道GPL平臺(tái)號(hào)，但是怎么把平臺(tái)和注釋信息...
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R語言配色方案: Colors in R前言：巧妙的色彩搭配，能夠繪制出更具審美價(jià)值的圖片，令人耳目一新。本文主要講解比較受歡迎的R包配色方案。 （一）：RColorBrewer 包 ...
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如何使用GEOquery和limma完成芯片數(shù)據(jù)的差異表達(dá)分析如何分析芯片數(shù)據(jù) 我最早接觸的高通量數(shù)據(jù)就是RNA-seq，后來接觸的也基本是高通量測(cè)序結(jié)果而不是芯片數(shù)據(jù)，因此我從來沒有分析過一次芯片數(shù)據(jù)，而...
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enrichplot||基因富集結(jié)果可視化解決方案enrichplot包實(shí)現(xiàn)了幾種可視化方法來幫助解釋富集結(jié)果。它支持從DOSE (Yu et al. 2015)、clusterProfiler...
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軟件的安裝
安裝java cdmkdir -p biosoft/javacd biosoft/javawget -c -O java.tar.gz http...
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samtools的安裝和使用--------------- Nickier 2018-12-21 --------------- samtools是一個(gè)用于操作sam和ba...
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ggplot2 008 箱線圖及小提琴圖1.箱線圖 Box plots 1.1 語法 geom_boxplot( mapping = NULL, data = NULL, stat =...
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轉(zhuǎn)錄組入門（7）：差異表達(dá)分析這個(gè)步驟推薦在R里面做，載入表達(dá)矩陣，然后設(shè)置好分組信息，統(tǒng)一用DEseq2進(jìn)行差異分析，當(dāng)然也可以走走edgeR或者limma的voom流程。...
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