導(dǎo)讀 關(guān)于如何將差異分析所得（上調(diào)或者下調(diào)）的代謝物進行KEGG通路的一個展示，除了利用大家熟知的Metaboanalyst[1]，以及R軟件包...
投稿
收錄了21篇文章 · 13人關(guān)注
-
差異代謝物的KEGG通路展示 -
免費的代謝組學(xué)分析軟件各個軟件列表和優(yōu)缺點如下： 1、XCMS XCMS是2006年發(fā)布的、基于R語言的用于LC-MS數(shù)據(jù)處理分析的軟件[2]。該軟件是命令行驅(qū)動的，...
-
用ggplot2畫代謝集富集分析（MSEA）圖MSEA 什么是MSEA MSEA，Metabolite Set Enrichment Analysis，代謝集富集分析，是代謝組數(shù)據(jù)分析方法的...
-
FELLA:代謝組學(xué)富集分析軟件介紹導(dǎo)讀 通路富集分析技術(shù)對于理解代謝組學(xué)數(shù)據(jù)背后的潛在生物學(xué)意義是非常有用的，它們的目的是根據(jù)代謝途徑中所包含的先驗知識，為受影響的代謝物提供上下...
-
【代謝組學(xué)】3.數(shù)據(jù)分析非靶向代謝組實驗設(shè)計 1.代謝物提取，一般要求每組至少10個樣；2.在所有提取好的樣本中取等量混合作為QC；3.QC樣本與實驗樣本穿插上機，開始...
-
ggplot2調(diào)整X軸標簽順序Create test data Now plot Order levels 鏈接地址：http://blog.sciencenet.cn/bl...
-
pheatmap()畫圖2一：創(chuàng)建矩陣： # Create test matrixtest = matrix(rnorm(200), 20, 10)test[1:10, ...
-
R數(shù)據(jù)可視化17:?；鶊D感覺100年沒有上簡書，近2個月忙于畢業(yè)論文以及公眾號推文，沒有時間更文章。終于前幾天交了論文呢，可以回來更文了。沒錯我只是在為我的懶惰尋找接口...
-
使用R包EnhancedVolcano繪制標記基因名字的火山圖環(huán)境：R_x64_4.0.2 & RStudio_1.2.1335相比網(wǎng)站生成火山圖，使用R語言生成火山圖可以滿足更多的要求，但相關(guān)文章不甚清晰...
-
R語言繪制火山圖火山圖 火山圖用于展示基因表達差異的分布，橫軸為Log2 Fold Change，越偏離中心差異倍數(shù)越大；縱軸為(-1)*Log10 P_adj...
{var%20f='http://v.t.sina.com.cn/share/share.php?appkey=1881139527',u=z||d.location,p=['&url=',e(u),'&title=',e(t||d.title),'&source=',e(r),'&sourceUrl=',e(l),'&content=',c||'gb2312','&pic=',e(p||'')].join('');function%20a(){if(!window.open([f,p].join(''),'mb',['toolbar=0,status=0,resizable=1,width=440,height=430,left=',(s.width-440)/2,',top=',(s.height-430)/2].join('')))u.href=[f,p].join('');};if(/Firefox/.test(navigator.userAgent))setTimeout(a,0);else%20a();})(screen,document,encodeURIComponent,'','','https://upload.jianshu.io/collections/images/1947911/%E4%B8%8B%E8%BD%BD.jpg', '推薦專題《R語言統(tǒng)計繪圖》（ 分享自 @簡書 ）','http://www.itdecent.cn/c/77eab30f67ac?utm_campaign=maleskine&utm_content=collection&utm_medium=reader_share&utm_source=weibo','頁面編碼gb2312|utf-8默認gb2312'));){kind=link}