在實(shí)踐之前，我先查找了一下有關(guān)組蛋白修飾的知識(shí)點(diǎn)：（參考文章：http://www.itdecent.cn/p/8aca72809c5c） 組...
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ChIP-seq實(shí)踐(H3K27Ac,enhancer的篩選和enhancer相關(guān)基因的GO分析) -
如何提取ATAC-seq數(shù)據(jù)的差異peaks?（DiffBind包的使用）2021年開(kāi)年第一篇筆記~ 這篇筆記主要記錄DiffBind包的學(xué)習(xí)。在很久以前我寫(xiě)過(guò)一篇ATAC-seq分析流程（ATAC-seq分析練習(xí)[h...
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ATAC-seq 片段長(zhǎng)度周期性分布圖參考： 給你bam文件，你會(huì)畫(huà)插入片段長(zhǎng)度分布圖嗎？ 糗世界-ATAC-seq 「文獻(xiàn)02」esATAC: 一個(gè)ATAC-seq分析的R包 【r...
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ATAC-seq背景知識(shí) 真核生物的DNA并不是裸露的，而是會(huì)與組蛋白結(jié)合。DNA纏繞在組蛋白上，形成串珠式結(jié)構(gòu)，珠是組蛋白，線是DNA。這樣的結(jié)構(gòu)進(jìn)一步折疊，...
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生信 | ATAC-Seq基礎(chǔ)分析+高級(jí)分析+多組學(xué)分析寫(xiě)在前面 其實(shí)很多作者已經(jīng)探索的差不多了，相關(guān)腳本、教程也很多，但我還是自己系統(tǒng)的總結(jié)一下吧。有時(shí)候感覺(jué)是浪費(fèi)時(shí)間，但是在寫(xiě)的時(shí)候能發(fā)現(xiàn)并學(xué)習(xí)到...
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比較Hi-C數(shù)據(jù)分析的計(jì)算方法基于Hi-C數(shù)據(jù)的深層挖掘和多組學(xué)聯(lián)合分析已經(jīng)成為了三維基因組領(lǐng)域的重要組成部分。而工欲善其事必先利其器，夯實(shí)基礎(chǔ)方能壘砌高臺(tái)。染色質(zhì)構(gòu)象各個(gè)層...
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