首先說明，這個問題是在一個偶然的情況下被發(fā)現(xiàn)的，因此可能不具備普遍性。事情是這樣的，我在昨天（6月4日）用clusterprofiler跑了以下...
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clusterprofiler跑GSEA時可能存在的問題（已解決） -
【R】clusterProfiler的GO/KEGG富集分析用法小結(jié)
前言 關(guān)于clusterProfiler這個R包就不介紹了，網(wǎng)紅教授宣傳得很成功，功能也比較強大，主要是做GO和KEGG的功能富集及其可視化。簡...
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clusterProfiler也能做細胞類型鑒定？在單細胞數(shù)據(jù)分析中，比較棘手的一件事莫過于細胞類型的鑒定了：雖然細胞可以用聚類算法聚成好幾類，每個類型的細胞是什么呢?這就考驗技術(shù)了。其實我們介...
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構(gòu)建自己的R包--KEGG.db
參考地址在使用clusterProfiler時，KEGG注釋包，可以自定義。畢竟許多物種的數(shù)據(jù)庫是不完善的?，F(xiàn)在就自定義一個KEGG.db的包，...
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clusterProfiler: 分析+可視化GO和KEGG富集的轉(zhuǎn)錄組R包寫作之友 基因和基因簇的功能譜 (functional profiles) 的統(tǒng)計學分析及可視化 G Yu, LG Wang, Y Han, Q...
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使用clusterProfiler包對非模式生物進行GO和KEGG的富集分析
clusterProfiler包是Y叔開發(fā)的一個強大的能進行多種功能富集的R包，對于有OrgDb或AnnotationHub中收錄的物種進行GO...
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