前言 RepeatMasker是一個通過已有數(shù)據(jù)庫預(yù)測重復序列的軟件，可以篩選DNA序列中的散在重復序列和低復雜序列，是重復序列注釋的重要軟件。...
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用python合并RepeatMasker預(yù)測結(jié)果中染色體的overlap區(qū)域
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RepeatModeler+RepeatMasker的安裝與使用一：RepeatMasker安裝 在基因組注釋中第一步就是重復序列的屏蔽，目前常用的從頭注釋pipeline就是RepeatModeler + ...
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LTR插入時間估算
本文方法是根據(jù)"Ageing LTR insertions"(https://github.com/SIWLab/Lab_Info/wiki/A...
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RepeatModeler2.0安裝及使用
RepeatModeler已更新，擁有了一些新的功能，可以識別LTR的結(jié)構(gòu)在基因組注釋中第一步就是重復序列的屏蔽，目前常用的從頭注釋pipeli...
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conda報錯Segmentation fault (core dumped)
今天安裝軟件時，發(fā)生報錯，經(jīng)過查詢，可能是之前安裝過這個軟件，但是不成功，部分文件下載一半就結(jié)束了。軟件在conda用不了時，可clean一下重...
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RepeatModeler2.0＋RepeatMasker??！!分享篇使用RepeatModeler2.0＋RepeatMasker 的時候，嚴格按照命令跑程序，出現(xiàn)結(jié)果不如我意代碼： 出現(xiàn)的結(jié)果： 我...
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基因組重復序列檢測：RepeatMasker的安裝及使用RepeatMasker是重復序列檢測的常用工具，通過與參考數(shù)據(jù)庫的相似性比對來準確識別或屏蔽基因組中的重復序列，屬于同源預(yù)測注釋的方式。下文除...
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