前言 WGDI軟件對于比較基因組分析非常實用，能夠分析全基因組復制事件，識別同源區(qū)塊，畫共線性點陣圖，求ka、ks值等，小編接下來先帶你安裝該軟...
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WGDI軟件（一）：安裝與配置
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WGDI | 比較基因組分析神器，要啥有啥！寫在前面 Emmm，前面推送了幾期好基友-比較基因組小王子的 WGDI 軟件使用和比較基因組圖表解讀。后臺常常受到消息，大體意思“快更新！”。原...
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用以判斷選擇壓力的Ka/Ks的計算前言 最近在看一些關于生態(tài)、遺傳、基因組進化等的文獻，其中有個很多人用的也用了很久的用以判斷物種選擇壓力的數(shù)值，（Ka/Ks）。發(fā)現(xiàn)在國內(nèi)的資料...
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組學工具合集
組學工具合集 整理了一些目前知道的與組學相關的工具，可能不全面，歡迎補充 基因組學 一代組裝 Celera Assembler: 最具代表性的工...
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全基因組復制 WGD |（二）Ka/Ks及4Dtv值計算轉自：http://www.itdecent.cn/p/9d28de3d18e6[http://www.itdecent.cn/p/9d28...
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如何用WGDI進行共線性分析(下)
在上一篇教程的最后，我寫道「我們能夠更加直觀的觀察到2個peak，基本確定2個多倍化事件」。這里就引出了一個問題，為什么我們可以根據(jù)peak來推...
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如何用WGDI進行共線性分析(中)
Ks可視化 我們在上一篇如何用WGDI進行共線性分析(一)[http://xuzhougeng.top/archives/comparative...
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如何用WGDI進行共線性分析(上)多倍化以及后續(xù)的基因丟失和二倍化現(xiàn)象存在于大部分的物種中, 是物種進化的重要動力。如果一個物種在演化過程中發(fā)生過多倍化，那么在基因組上就會存在一...
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WGD（全基因組復制）分析——Ka/Ks及4Dtv值計算一、4Dtv（四倍簡并位點顛換率）的定義 4DTV stands for four-fold synonymous (degenerative)...
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【豆科基因組】綠豆Mungbean, Vigna radiata基因組2014NC來源 Kang, Y., Kim, S., Kim, M. et al. Genome sequence of mungbean and ins...
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