說在前面: 早在 2009 年,韓斌團(tuán)隊(第一作者是黃學(xué)輝)就在 Genome Res 上發(fā)了一篇文章 High-throughput geno...
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說在前面: 早在 2009 年,韓斌團(tuán)隊(第一作者是黃學(xué)輝)就在 Genome Res 上發(fā)了一篇文章 High-throughput geno...
寫在前面 快一年了,寫了重測序三兄弟插件,幾乎所有用戶都可以用 TBtools 輕松完成 BSAseq 數(shù)據(jù)分析。當(dāng)然,我自己基本也沒怎么折騰過...
通過前面兩篇文章對MutMap原理和分析流程的介紹,我們對MutMap的分析已經(jīng)有了比較深入的了解,是時候來點(diǎn)兒數(shù)據(jù)實戰(zhàn)一下了! MutMap的...
文末可下載示例數(shù)據(jù)和代碼。 前幾天,老師讓我畫一個這樣的圖。 粗略一看,似乎沒有什么特別困難的地方,好像之前也看到過類似的圖,但是看到老師發(fā)來的...
binmapr是我折騰的一個R包,它能夠?qū)GS測序得到SNP數(shù)據(jù)基于binmap進(jìn)行糾錯,用于更好的遺傳定位。 在閱讀本文之前,請先花點(diǎn)時間看...
QTLseqr是一個用于BSA-seq的R包,它能夠讀取GATK輸出結(jié)果進(jìn)行過濾,最終使用SNP-index和G 統(tǒng)計值的方法進(jìn)行定位。我們這次...
許多重要的農(nóng)藝性狀為數(shù)量性狀,由多個基因位點(diǎn)控制。利用傳統(tǒng)的分子標(biāo)記技術(shù)進(jìn)行基因定位,常常需要花費(fèi)較長的時間和大量的人力物力。2012年日本巖手...
BSA雖然不是我最早接觸的高通量數(shù)據(jù)分析項目(最早的是RNA-seq),但是卻是我最早獨(dú)立開展的數(shù)據(jù)分析項目, 我曾經(jīng)專門寫過一篇文章介紹如何使...
BSA(Bulked Segregant Analysis),集群分離分析或分離群體分組分析法。兩個特點(diǎn):1. 混池2. 性狀分離所以,BSA可...