前言:寫這篇文章的目的是為了梳理一下學(xué)習(xí)思路,按部就班地仿生信菜鳥(niǎo)團(tuán)和簡(jiǎn)書:Y大寬教程大綱,做歸納整理,即便再次運(yùn)行,仍然遇到代碼出錯(cuò)或者軟件使...
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前言:寫這篇文章的目的是為了梳理一下學(xué)習(xí)思路,按部就班地仿生信菜鳥(niǎo)團(tuán)和簡(jiǎn)書:Y大寬教程大綱,做歸納整理,即便再次運(yùn)行,仍然遇到代碼出錯(cuò)或者軟件使...
STAR+RSEM+Deseq2視頻課程鏈接已經(jīng)公開(kāi), https://www.bilibili.com/video/BV1KJ411p7WN?...
Y叔的RNA-seq workflow 強(qiáng)力推薦[https://github.com/twbattaglia/RNAseq-workflow]...
劉小澤寫于19.1.25最近要開(kāi)始一批無(wú)參轉(zhuǎn)錄組學(xué)習(xí),我喜歡在學(xué)東西時(shí)先學(xué)一些知識(shí)儲(chǔ)備,現(xiàn)在不太喜歡拿來(lái)代碼直接去跑,可能對(duì)背后的原理性東西想要...
劉小澤寫于19.2.1??發(fā)覺(jué)好久沒(méi)寫了,果然臨近過(guò)年事情比較多,最近重新開(kāi)始無(wú)參轉(zhuǎn)錄組。這次先從數(shù)據(jù)下載做到得到組裝的轉(zhuǎn)錄本 數(shù)據(jù)來(lái)源 Defi...
好久沒(méi)更新啦,因?yàn)樽罱鼪](méi)有在跑項(xiàng)目哦,所以就擱置了,最近要做一兩張圖,所以把前面寫的教程先發(fā)布一下~ 前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--...
前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq(一)一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq(二)QC 3 ...
前期文章 一個(gè)超簡(jiǎn)單的轉(zhuǎn)錄組項(xiàng)目全過(guò)程--iMac+RNA-Seq(一) Q1: 在上一期中,有人問(wèn)到:為什么不能用toplevel的參考基因組...
由于實(shí)驗(yàn)室沒(méi)有服務(wù)器,我只有一臺(tái)iMac,跟之前學(xué)的時(shí)候已經(jīng)有完善的服務(wù)器系統(tǒng)完全不一樣,我需要在iMac上搭建環(huán)境用于分析數(shù)據(jù)。 0. 準(zhǔn)備工...
參考:轉(zhuǎn)錄組分析記錄; 轉(zhuǎn)錄組入門和進(jìn)階以下內(nèi)容為轉(zhuǎn)錄組全部的上游分析,包括下載數(shù)據(jù)、比對(duì)、計(jì)數(shù)得到表達(dá)矩陣。https://www.ncbi....