JCVI的使用基本格式為python -m jcvi.模塊.子功能 實際操作,因此了解JCVI的模塊能夠幫助我們?nèi)フ业叫枰墓δ?。根?jù)JCVI的...
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JCVI的使用基本格式為python -m jcvi.模塊.子功能 實際操作,因此了解JCVI的模塊能夠幫助我們?nèi)フ业叫枰墓δ?。根?jù)JCVI的...
1. 安裝jcvi 可以直接conda安裝,記得在python2的環(huán)境下哦,3會報錯。 2. 準備文件(CDS,pep,gff3) 3. 我們分...
在「JCVI教程」編碼序列或蛋白序列運行共線性分析流程(上)還是有一個尷尬的事情,就是只用到兩個物種,不能展示出JCVI畫圖的方便之處,因此這里...
這是唐海寶老師GitHub上的JCVI工具的非官方說明書。該工具集的功能非常多,但是教程資料目前看起來并不多,因此為了能讓更多人用上那么好用的工...
這是唐海寶老師GitHub上的JCVI工具的非官方說明書。該工具集的功能非常多,但是教程資料目前看起來并不多,因此為了能讓更多人用上那么好用的工...
最近發(fā)現(xiàn)了python版的MCScan,是個大寶藏。由于走了不少彎路,終于畫出美圖,趕緊記錄下來 github地址 https://github...
目錄MCScanX下載及安裝數(shù)據(jù)準備MCScanX運行及結果Ka & Ks 計算下游畫圖腳本最后 MCScanX有兩個主要的功能, 一是, 方便...
基因組共線性工具MCScanX使用說明 簡介 MCScanX工具集對MCScan算法進行了調(diào)整,用于檢測共線性和同線性區(qū)域,還增加了可視化和下游...
寫在前面 類似的主題,我們已經(jīng)推出了一篇主題為《一鍵完成共線性(MCScanX)分析》的文章。推出之后一部分人用著挺好。也有相當部分朋友卻不知為...
MCScanX是檢測基因共線性和進化分析的常用工具之一,2012發(fā)表至今引用數(shù)200+,作者之一的唐海寶老師是國內(nèi)植物基因組學生信分析、軟件開發(fā)...